158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4776 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4776  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
296 aa  589  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.17516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1190  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 
302 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.759069  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1282  rod shape-determining protein MreC  33.2 
 
 
296 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1671  rod shape-determining protein MreC  34.7 
 
 
296 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575744 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  28.83 
 
 
275 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  27.46 
 
 
276 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  29 
 
 
317 aa  86.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  27.99 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  26.05 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  26.89 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  27.73 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  23.08 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  24.71 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  24.74 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  25.3 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  25.85 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  26.27 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  26.84 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  31.79 
 
 
256 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  26.99 
 
 
286 aa  62.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  25.69 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  25.3 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  25.33 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  25.89 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  25.52 
 
 
287 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  24.9 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  20.07 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  24.66 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  25.79 
 
 
277 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 
255 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  27.98 
 
 
281 aa  59.7  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  26.39 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  24.82 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  19.72 
 
 
283 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  23.46 
 
 
288 aa  58.9  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  21.35 
 
 
359 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  25.29 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 
243 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7284  rod shape-determining protein MreC  25.19 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  24.74 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  23.62 
 
 
324 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  24.9 
 
 
274 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  24.89 
 
 
287 aa  55.8  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  26.13 
 
 
304 aa  55.8  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  24.7 
 
 
272 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  24.88 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  23.67 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 
448 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  25.36 
 
 
316 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  22.03 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  22.26 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  27.11 
 
 
315 aa  53.5  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  23.96 
 
 
257 aa  52.8  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  24.57 
 
 
311 aa  52.8  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  27.55 
 
 
302 aa  52.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  23.27 
 
 
280 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  23.27 
 
 
280 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  24.64 
 
 
316 aa  52.4  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  25.3 
 
 
311 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 
251 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  23.37 
 
 
278 aa  52  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  23.02 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  23.31 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 
331 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 
331 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 
331 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  20.74 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 
249 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  28.74 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 
249 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  25.91 
 
 
407 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  26.9 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  26.74 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  26.94 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  25.4 
 
 
292 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  24.2 
 
 
283 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  23.62 
 
 
288 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  23.01 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  22.14 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  27.72 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  24.83 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  24.57 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  23.89 
 
 
366 aa  48.9  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  26.73 
 
 
346 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  25.12 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  25.19 
 
 
355 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  25.86 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3831  rod shape-determining protein MreC  23.83 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277446  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  20.38 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  25.37 
 
 
251 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  24.81 
 
 
358 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>