53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3589 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  625  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  34.65 
 
 
327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  30.34 
 
 
347 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  30.65 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  27.9 
 
 
442 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  30.94 
 
 
470 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  33.44 
 
 
369 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  30.26 
 
 
406 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  29.28 
 
 
502 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  28.66 
 
 
502 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  31.07 
 
 
377 aa  99  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  29.47 
 
 
437 aa  95.9  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  28.09 
 
 
428 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  30.98 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  29.51 
 
 
442 aa  93.2  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  40.26 
 
 
468 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  28.71 
 
 
392 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  28.71 
 
 
392 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  28.71 
 
 
392 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  27.22 
 
 
445 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  35.08 
 
 
397 aa  82.4  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  32.34 
 
 
366 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  26.88 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  27.91 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  25.66 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  28.01 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  32.97 
 
 
411 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  34.07 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  32.65 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  28.62 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  31.55 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  31.72 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  28.57 
 
 
329 aa  68.9  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  29.15 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  28.78 
 
 
336 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  27.24 
 
 
492 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  29 
 
 
338 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  28.4 
 
 
205 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  31.1 
 
 
228 aa  59.3  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  26.79 
 
 
234 aa  56.6  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  28.11 
 
 
374 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  25.47 
 
 
224 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  30.86 
 
 
439 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  32.43 
 
 
216 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  26.63 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  32 
 
 
389 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  27.41 
 
 
226 aa  46.2  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  32.52 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  31.25 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4020  hypothetical protein  29.82 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  28.18 
 
 
332 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  27.98 
 
 
397 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  30.27 
 
 
267 aa  42.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>