More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2584 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
311 aa  615  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.06 
 
 
314 aa  331  8e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.63 
 
 
311 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.92 
 
 
322 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.61 
 
 
317 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.12 
 
 
320 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.55 
 
 
312 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.55 
 
 
312 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  37.99 
 
 
285 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.09 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.81 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.89 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
311 aa  133  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.89 
 
 
249 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.15 
 
 
310 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.33 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.93 
 
 
241 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 
245 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 
317 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.59 
 
 
193 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  33.16 
 
 
241 aa  96.7  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.96 
 
 
250 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  27.54 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0028  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.33 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170519  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.33 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  26.48 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  23.47 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
286 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.01 
 
 
321 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.69 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  29.69 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  16.29 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.69 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.69 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.69 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.64 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.46 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.94 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  21.86 
 
 
318 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
277 aa  63.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 
328 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.1 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
309 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  23.49 
 
 
297 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
292 aa  62.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.94 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  23.94 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
296 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.94 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.94 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  24.65 
 
 
297 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  23.96 
 
 
302 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  23.96 
 
 
302 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.96 
 
 
302 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
311 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  24.65 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
314 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  24.65 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  24.65 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.38 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>