223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1961 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 387 aa  772    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  71.17 
 
 		 333 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  68.92 
 
 		 333 aa  450  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  68.42 
 
 		 330 aa  441  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  69.09 
 
 		 352 aa  444  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  61.93 
 
 		 330 aa  415  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  62.05 
 
 		 332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  63.86 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  61.45 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  58.52 
 
 		 350 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  57.03 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  54.67 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  54.67 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  54.67 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  50.26 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  58.97 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  56.35 
 
 		 328 aa  365  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  54.57 
 
 		 352 aa  364  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  56.44 
 
 		 332 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  55.26 
 
 		 332 aa  363  4e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  58.13 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  58.67 
 
 		 419 aa  358  8e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  58.7 
 
 		 330 aa  357  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  55.33 
 
 		 369 aa  352  8.999999999999999e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  52.12 
 
 		 360 aa  349  5e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  58.07 
 
 		 346 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  58.07 
 
 		 346 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  58.07 
 
 		 346 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  51.61 
 
 		 342 aa  338  7e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  51.83 
 
 		 341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  55.38 
 
 		 328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  50.61 
 
 		 362 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  52.91 
 
 		 330 aa  332  9e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  51.04 
 
 		 337 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  52.34 
 
 		 348 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  53.36 
 
 		 342 aa  328  7e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  49.71 
 
 		 343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  57.14 
 
 		 474 aa  324  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  54.43 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  52.33 
 
 		 367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  52.38 
 
 		 328 aa  307  3e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  52.69 
 
 		 348 aa  306  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  52.8 
 
 		 324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  51.23 
 
 		 338 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  50.15 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  54.43 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  40.6 
 
 		 339 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  52.35 
 
 		 337 aa  265  8.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  52.15 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  45.02 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  50.75 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  44.55 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  44.55 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  44.55 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  41.99 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  44.51 
 
 		 337 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  42.77 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  44.72 
 
 		 334 aa  252  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  42.24 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  42.98 
 
 		 344 aa  249  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  40.27 
 
 		 360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  47.48 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  47.53 
 
 		 346 aa  239  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4839  Integral membrane protein TerC  49.25 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  43.69 
 
 		 313 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  42.12 
 
 		 344 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  41.12 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  40.68 
 
 		 342 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  43.27 
 
 		 334 aa  229  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  47.99 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  46.06 
 
 		 373 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  42.32 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  38.25 
 
 		 320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  39.63 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  43.59 
 
 		 311 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  39.57 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  40.56 
 
 		 329 aa  219  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  39.08 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  35.52 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  40 
 
 		 314 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  40.55 
 
 		 320 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11220  tellurium resistance membrane protein TerC  50.68 
 
 		 310 aa  217  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  38.55 
 
 		 352 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  40.55 
 
 		 320 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  37.18 
 
 		 354 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  36.89 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  40.9 
 
 		 325 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  36.57 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  39.88 
 
 		 321 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  38.8 
 
 		 306 aa  209  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  37.42 
 
 		 305 aa  209  8e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  39.12 
 
 		 307 aa  209  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  40 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  36.04 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  38.87 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  34.7 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  38.94 
 
 		 327 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  39.46 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  36.62 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  36.36 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>