More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1319 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1319  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  238  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  53.1 
 
 		 232 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.65 
 
 		 1361 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.17 
 
 		 1390 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.17 
 
 		 1390 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.17 
 
 		 1390 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 227 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  47.06 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 225 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.72 
 
 		 1248 aa  100  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  60.87 
 
 		 1383 aa  99.4  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 235 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.03 
 
 		 1711 aa  98.6  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  46.09 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 231 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.78 
 
 		 1370 aa  97.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 227 aa  97.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  47.11 
 
 		 241 aa  97.1  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 236 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 231 aa  96.7  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 232 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 224 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  49.57 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.54 
 
 		 1385 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 224 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 228 aa  94.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 523 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 234 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 228 aa  94  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  41.41 
 
 		 265 aa  93.6  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.22 
 
 		 226 aa  93.6  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 270 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 229 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.61 
 
 		 443 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  41.03 
 
 		 223 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  41.03 
 
 		 223 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.32 
 
 		 310 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 223 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 228 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.61 
 
 		 443 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  37.39 
 
 		 228 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 223 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 223 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 223 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6685  two component transcriptional regulator  43.09 
 
 		 234 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 223 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 229 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 232 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2671  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 243 aa  91.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.09 
 
 		 239 aa  92  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  43.48 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 223 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  43.48 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  43.48 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  43.48 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.48 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.48 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  44.35 
 
 		 225 aa  91.3  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.8 
 
 		 261 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 236 aa  91.7  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 239 aa  91.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  43.48 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  40.17 
 
 		 227 aa  91.3  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.9 
 
 		 1426 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 223 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  48.76 
 
 		 246 aa  91.3  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  43.48 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  43.48 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 229 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2316  response regulator  42.02 
 
 		 527 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000645629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 238 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.38 
 
 		 231 aa  90.9  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 233 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 227 aa  90.9  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 237 aa  90.5  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 230 aa  90.5  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 217 aa  90.9  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13275  two component system sensor transduction transcriptional regulatory protein mtrA  44.64 
 
 		 228 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.656178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 229 aa  90.5  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  41.46 
 
 		 234 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.53 
 
 		 326 aa  90.1  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.4 
 
 		 237 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1752  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 223 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.41 
 
 		 234 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 238 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 225 aa  89.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 229 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>