More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1444 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  100 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  61.39 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  43.95 
 
 		 184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  36.81 
 
 		 185 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  38.41 
 
 		 193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  35.58 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  35.58 
 
 		 185 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  35.93 
 
 		 185 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  34.68 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  35.98 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  35.98 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  38.27 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  35.98 
 
 		 214 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  34.46 
 
 		 191 aa  99  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  32.95 
 
 		 234 aa  98.6  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  32.76 
 
 		 205 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  38.61 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4235  polysaccharide export protein  35.36 
 
 		 205 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.694304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  33.13 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  32.32 
 
 		 206 aa  89  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  31.71 
 
 		 495 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4285  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0419531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  34.12 
 
 		 386 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  40.48 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  34.73 
 
 		 216 aa  85.5  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  33.53 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  34.71 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  32.93 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  28.3 
 
 		 1055 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  29.01 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  35.37 
 
 		 948 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  32.94 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  30.86 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3531  lipoprotein PslD  33.58 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.717769  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.53 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  37.96 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  32.95 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  31.76 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  37.96 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  26.9 
 
 		 495 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 495 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  38.17 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  34.62 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  35.53 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  36.15 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 919 aa  79  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  35.53 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  33.11 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  31.06 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3303  polysaccharide export protein  34.06 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0200741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  30.41 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  31.52 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  28.16 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 952 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  38.97 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  31.01 
 
 		 828 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  26.44 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  34.64 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3450  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.04 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  29.56 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.18 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  30.77 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  31.61 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 478 aa  76.3  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  31.61 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  31.01 
 
 		 828 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  30.59 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.61 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  29.38 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  31.61 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.24 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  31.61 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.61 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.61 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.24 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.24 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  28.9 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  31.52 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.16 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.16 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 920 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  30.19 
 
 		 910 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 393 aa  75.5  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  28.82 
 
 		 378 aa  75.1  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  27.59 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  27.59 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  26.5 
 
 		 852 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.59 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.59 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.59 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  28.25 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  27.07 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>