More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3600 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3600  response regulator receiver protein  100 
 
 		 134 aa  273  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2931  response regulator receiver protein  70 
 
 		 134 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0438  response regulator receiver protein  70.45 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.186072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1120  response regulator  62.2 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1663  response regulator receiver protein  61.42 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2550  response regulator receiver protein  61.42 
 
 		 135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35149e-19 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.59 
 
 		 303 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2881  response regulator receiver protein  44.71 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000073998  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.33 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 316 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.95 
 
 		 229 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  38.27 
 
 		 734 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  37.21 
 
 		 1127 aa  63.5  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  26.83 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.48 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  27.42 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1037  sensory box/response regulator  33.61 
 
 		 799 aa  62  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.6 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 934 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  28.46 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  31.75 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  28.46 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  28.46 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  28.46 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  28.46 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  28.46 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 238 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  28.46 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  31.75 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3413  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.18 
 
 		 453 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  36.05 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  29.37 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.83 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.5 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3042  two-component response regulator  29.03 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.330896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.89 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  29.37 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  33.33 
 
 		 394 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  33.33 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2669  DNA-binding response regulator  27.73 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0406504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  33.65 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.4 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4213  response regulator receiver domain-containing protein  29.03 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.871258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.71 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  30.77 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3475  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.82 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0804749 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.33 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  30.89 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4368  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  29.03 
 
 		 487 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2896  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 367 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00201335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  33.96 
 
 		 1156 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 806 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2906  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 367 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0132666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1467  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 367 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0140274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  24.6 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  28.8 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3355  two component Fis family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 460 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  25.42 
 
 		 1374 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  33.65 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3303  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.28 
 
 		 366 aa  58.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.919259 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2067  Spo0A protein  29.6 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  28.35 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1781  Spo0A protein  29.6 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7238  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24892  normal  0.77163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.62 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  30.08 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2877  DNA-binding response regulator  27.73 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2867  DNA-binding response regulator  27.73 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000859212 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2621  two-component response regulator  27.73 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2910  DNA-binding response regulator  27.73 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.62 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0544  two component transcriptional regulator  29.23 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  33.59 
 
 		 1335 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 393 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  25.76 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4152  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.87 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3038  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 367 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  33.87 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3615  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.27 
 
 		 450 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.468423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  34.4 
 
 		 277 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.56 
 
 		 234 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  34.09 
 
 		 422 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  25 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 461 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000196128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2074  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00164535  hitchhiker  0.00140528 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  29.1 
 
 		 241 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  29.1 
 
 		 241 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>