More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0985 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  51.44 
 
 		 285 aa  286  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  49.1 
 
 		 294 aa  275  8e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  50.19 
 
 		 285 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  49.27 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  49.28 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  46.74 
 
 		 288 aa  264  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  49.43 
 
 		 299 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  48.64 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  46.64 
 
 		 291 aa  231  9e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  44.96 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  44.1 
 
 		 333 aa  215  9e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  42.35 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  42.75 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  39.15 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  42.02 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  41.02 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  39.3 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  39.3 
 
 		 285 aa  175  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  37.03 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  37.79 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  42.27 
 
 		 222 aa  155  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  36.26 
 
 		 305 aa  155  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  36.65 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  36.63 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  46.19 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  35.79 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  37.98 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  44.86 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 382 aa  145  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  35.29 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  36.01 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  41.94 
 
 		 355 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  36.99 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  41.94 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.07 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  35.89 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  41.03 
 
 		 381 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  35.21 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  32.73 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  39.04 
 
 		 388 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  35 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  39.06 
 
 		 374 aa  136  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.58 
 
 		 360 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 381 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  37.69 
 
 		 366 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  37.72 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  36.64 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  34.88 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  34.64 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  40.86 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  41.29 
 
 		 381 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  37.97 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  39 
 
 		 363 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  36.22 
 
 		 341 aa  132  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  35.13 
 
 		 311 aa  132  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  35.35 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  43.72 
 
 		 330 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  37.32 
 
 		 288 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  37.66 
 
 		 407 aa  132  9e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  36.91 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  33.45 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  37.21 
 
 		 352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  40.88 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  37.13 
 
 		 366 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  40.88 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  36.7 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.72 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.84 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.81 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  37.23 
 
 		 364 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  35.32 
 
 		 396 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40 
 
 		 374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  51.8 
 
 		 581 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  36.62 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  32.65 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.08 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  36.7 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  41.62 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  36.7 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  38.58 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  34.42 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  34.42 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  34.42 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  37.56 
 
 		 368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  37.56 
 
 		 368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  37.56 
 
 		 368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  37.56 
 
 		 368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1974  A/G-specific adenine glycosylase  38.86 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  38.81 
 
 		 354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  36.17 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  36.28 
 
 		 360 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.54 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  33.21 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  36.82 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  39.39 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  39.39 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  36.17 
 
 		 365 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  39.39 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>