More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0493 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3213  ABC transporter related  75.72 
 
 
250 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  71.95 
 
 
262 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  70.33 
 
 
254 aa  351  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1244  ABC transporter related  71.49 
 
 
252 aa  338  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  40.51 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  43.42 
 
 
244 aa  189  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  42.68 
 
 
248 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  42.68 
 
 
248 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  42.68 
 
 
248 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  41.1 
 
 
244 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  41.32 
 
 
248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  42.28 
 
 
275 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  37.7 
 
 
257 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  40.35 
 
 
244 aa  178  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  41.32 
 
 
252 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  40.16 
 
 
259 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  39 
 
 
255 aa  176  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 
267 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  41.49 
 
 
252 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  41.39 
 
 
279 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  39.26 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  40 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  40.51 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  38.84 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  38.4 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 
255 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  38.91 
 
 
273 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  38.27 
 
 
273 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  38.2 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  36.48 
 
 
266 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  38.16 
 
 
244 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  38.84 
 
 
248 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  38.84 
 
 
248 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  39.2 
 
 
261 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  38.02 
 
 
268 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  39.04 
 
 
244 aa  170  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  37.92 
 
 
273 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  40.93 
 
 
277 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  39.43 
 
 
271 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  41.42 
 
 
248 aa  169  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  37.08 
 
 
273 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  37.08 
 
 
273 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  37.34 
 
 
269 aa  168  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  40.27 
 
 
275 aa  168  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  38.11 
 
 
263 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  38.4 
 
 
257 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 
272 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  36.25 
 
 
273 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  37.99 
 
 
289 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 
294 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  36.25 
 
 
273 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  38.53 
 
 
244 aa  166  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 
272 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  40.98 
 
 
276 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  36.25 
 
 
273 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  39.3 
 
 
256 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 
264 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  37.75 
 
 
256 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  36.25 
 
 
273 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  36.25 
 
 
273 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  36.02 
 
 
296 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  37.76 
 
 
306 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  37.95 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  39.91 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1143  ABC transporter related  40.57 
 
 
276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  37.05 
 
 
397 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  38.24 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  40.23 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  40.23 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  37.29 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4360  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  40.83 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132306  normal  0.0534611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  37.23 
 
 
283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  37.78 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  38.84 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 
272 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 
272 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 
272 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  36.75 
 
 
272 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.02 
 
 
266 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  37.13 
 
 
245 aa  162  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  37.77 
 
 
257 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 
272 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 
272 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 
272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  36.6 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  38.16 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  37.55 
 
 
250 aa  162  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  38.64 
 
 
269 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2891  ABC transporter, ATPase subunit  38.7 
 
 
282 aa  162  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  36.14 
 
 
261 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  35.8 
 
 
269 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  37.13 
 
 
279 aa  162  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  38.86 
 
 
276 aa  162  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  37.92 
 
 
274 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.92 
 
 
276 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  37.55 
 
 
248 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  36.67 
 
 
270 aa  161  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  35.27 
 
 
249 aa  160  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  37.55 
 
 
278 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>