More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1480 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  782    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  70.37 
 
 		 397 aa  544  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  63.19 
 
 		 392 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  60.42 
 
 		 394 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  57.18 
 
 		 383 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  56.1 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  56.88 
 
 		 384 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  55.67 
 
 		 409 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  52.12 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  53.58 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  52.48 
 
 		 383 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  48.7 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  49.09 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  51.84 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  53.05 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  48.95 
 
 		 385 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  53.05 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  52.37 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  48.04 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  51.32 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  53.64 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  47.78 
 
 		 384 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  51.06 
 
 		 383 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  54.67 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.32 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  50.66 
 
 		 384 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  54.4 
 
 		 397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  50.78 
 
 		 391 aa  359  4e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  52.01 
 
 		 382 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  54.35 
 
 		 387 aa  355  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  50.66 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  53.19 
 
 		 413 aa  351  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  49.74 
 
 		 386 aa  350  3e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  47.85 
 
 		 393 aa  349  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  49.61 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  50.8 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 		 387 aa  341  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  49.19 
 
 		 387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  49.47 
 
 		 397 aa  335  7e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  46.72 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  49.1 
 
 		 395 aa  332  8e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  48.4 
 
 		 409 aa  325  7e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  48.03 
 
 		 400 aa  325  7e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  47.18 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  46.76 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  48.66 
 
 		 395 aa  323  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  46.79 
 
 		 393 aa  321  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  46.54 
 
 		 391 aa  319  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  46.97 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  48.82 
 
 		 401 aa  313  4.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  45.31 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  41.8 
 
 		 386 aa  309  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  41.8 
 
 		 386 aa  309  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  45.21 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  42.18 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  41.8 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  41.8 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  45.83 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  49.6 
 
 		 421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  44.53 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  44.53 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  41.8 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  44.53 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  44.53 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  41.8 
 
 		 386 aa  307  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  44.53 
 
 		 391 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  44.53 
 
 		 391 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  41.53 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  45.89 
 
 		 391 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  44.27 
 
 		 384 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  43.68 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  41.91 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  44.41 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  44.41 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  41.27 
 
 		 386 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  44.59 
 
 		 389 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  41.91 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  41.11 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  44.71 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  43.62 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  43.88 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  43.88 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  44.56 
 
 		 383 aa  300  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  43.62 
 
 		 389 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  44.15 
 
 		 390 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  43.39 
 
 		 379 aa  298  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  41.38 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  48.94 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  41.27 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  43.88 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  43.35 
 
 		 390 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  44.03 
 
 		 383 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  42.48 
 
 		 396 aa  295  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  40.85 
 
 		 393 aa  294  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  45.95 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  45.95 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  41.01 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  41.01 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  43.83 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.95 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>