95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0800 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  42.93 
 
 		 192 aa  144  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  46.39 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  42.71 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  41.41 
 
 		 192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  44.33 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  42.41 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  49.38 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  37.1 
 
 		 195 aa  124  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  40 
 
 		 191 aa  118  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  39.19 
 
 		 464 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  37.17 
 
 		 462 aa  111  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  37.57 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  39.52 
 
 		 708 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  41.26 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  35.91 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  38.62 
 
 		 471 aa  98.2  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  38.02 
 
 		 464 aa  97.8  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  36.31 
 
 		 447 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  36.14 
 
 		 240 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  39.16 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  38.19 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  36.14 
 
 		 427 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  34.93 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  34.05 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  28.89 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  33.33 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  36.09 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  34.67 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  30.61 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 		 1001 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  37.07 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 		 1015 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  30.51 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3833  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  27.82 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  29.17 
 
 		 267 aa  51.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  29.17 
 
 		 267 aa  51.6  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  29.17 
 
 		 267 aa  51.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  25.45 
 
 		 2012 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  29.82 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  32.66 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.38 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.35 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  30.28 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 348 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  32.04 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.71 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 309 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 354 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  26.05 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.71 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 273 aa  45.1  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 250 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.45 
 
 		 258 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  35.45 
 
 		 189 aa  44.7  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.88 
 
 		 328 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  35.45 
 
 		 189 aa  44.7  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  34.91 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  33.01 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  24.66 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.39 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  28.39 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  26.67 
 
 		 247 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 260 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.72 
 
 		 229 aa  42.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2162  hypothetical protein  27.89 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0386731 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.2 
 
 		 276 aa  42.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 327 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  33.05 
 
 		 331 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 269 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 254 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  26.4 
 
 		 247 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  26.4 
 
 		 247 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  26.4 
 
 		 247 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2377  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 190 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.954171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  26.4 
 
 		 247 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  26.4 
 
 		 247 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 339 aa  42  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  23.08 
 
 		 250 aa  42  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 249 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  27.36 
 
 		 3639 aa  41.6  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.75 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  33.06 
 
 		 335 aa  41.2  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  24.62 
 
 		 251 aa  41.2  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26 
 
 		 241 aa  41.2  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  34.74 
 
 		 250 aa  41.2  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>