More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4390 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 361 aa  698    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  49.12 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  48.69 
 
 		 340 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  48.64 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  48.64 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  48.64 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  48.24 
 
 		 342 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  43.03 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  42.82 
 
 		 375 aa  192  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  40.23 
 
 		 335 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  38.27 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  39.27 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  38.11 
 
 		 385 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  35.94 
 
 		 375 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  37.86 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  37.61 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  34.92 
 
 		 374 aa  136  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  35.9 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  39.89 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  36.08 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  36.26 
 
 		 388 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  31.94 
 
 		 356 aa  129  8.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  35.22 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  34.87 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  34.88 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  36.7 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  35.26 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  37.75 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  35.42 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  31.1 
 
 		 652 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  29.29 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  32.72 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.5 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  30 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  33.61 
 
 		 411 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  31.15 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  33.6 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  29.51 
 
 		 454 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.43 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.43 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.27 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  35.16 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  30.62 
 
 		 368 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 354 aa  97.4  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  32.87 
 
 		 339 aa  97.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.02 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  29.92 
 
 		 450 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  32.35 
 
 		 325 aa  96.3  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  34.19 
 
 		 389 aa  95.9  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.17 
 
 		 386 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.11 
 
 		 316 aa  95.9  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  34.8 
 
 		 684 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  33.96 
 
 		 389 aa  93.6  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  25.89 
 
 		 367 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  30.19 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  27.84 
 
 		 1033 aa  93.2  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  33.33 
 
 		 652 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  29.04 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  27.49 
 
 		 666 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  30.65 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2398  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  32.94 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  25.43 
 
 		 365 aa  90.9  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2464  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 358 aa  89.7  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  27.49 
 
 		 666 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  30.5 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 386 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  30.7 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.77 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 378 aa  86.3  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  29.94 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  28.98 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  23.39 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  30.49 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  29.29 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  24.71 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  24.71 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  29.11 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  28.02 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  29.65 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  30.3 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.68 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.96 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  22.81 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.68 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  26.23 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  31.65 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  26.5 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  28.44 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.96 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>