More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4140 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  100 
 
 		 548 aa  1072    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  57.64 
 
 		 562 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  53.01 
 
 		 566 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  51.69 
 
 		 540 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  46.76 
 
 		 600 aa  429  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 553 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  45.45 
 
 		 552 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  45.74 
 
 		 548 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  45.9 
 
 		 509 aa  360  5e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.047738  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  42.24 
 
 		 554 aa  346  6e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  39.5 
 
 		 537 aa  286  9e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1063  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 671 aa  262  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  39.31 
 
 		 563 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  40.52 
 
 		 563 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  36.32 
 
 		 603 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  39.21 
 
 		 536 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  37.1 
 
 		 561 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  35.58 
 
 		 546 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.95 
 
 		 564 aa  222  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  32.27 
 
 		 547 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.56 
 
 		 583 aa  217  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  35.8 
 
 		 551 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0250  ATPase  32.39 
 
 		 662 aa  204  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.94 
 
 		 585 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.06 
 
 		 550 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.21 
 
 		 668 aa  197  5.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  30.04 
 
 		 641 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  37.26 
 
 		 550 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2203  ABC transporter related  31.46 
 
 		 669 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.67 
 
 		 553 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  31.11 
 
 		 723 aa  190  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.83 
 
 		 555 aa  190  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0909  ABC transporter related  39.81 
 
 		 563 aa  190  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.5 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  29.87 
 
 		 630 aa  189  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.37 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  31.16 
 
 		 648 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  32.13 
 
 		 606 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  35.8 
 
 		 551 aa  187  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.78 
 
 		 635 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  28.78 
 
 		 663 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  33.21 
 
 		 631 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  27.29 
 
 		 636 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  32.57 
 
 		 672 aa  185  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 		 545 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.26 
 
 		 635 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  26.52 
 
 		 643 aa  184  3e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.26 
 
 		 635 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  27.96 
 
 		 644 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.26 
 
 		 635 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  28.55 
 
 		 663 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.79 
 
 		 555 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  33.52 
 
 		 553 aa  184  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  33.02 
 
 		 537 aa  183  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  27.78 
 
 		 642 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  27.78 
 
 		 642 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.07 
 
 		 635 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.68 
 
 		 555 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.33 
 
 		 589 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3514  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.5 
 
 		 554 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491494  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.71 
 
 		 555 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  29.63 
 
 		 536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  37.59 
 
 		 543 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.03 
 
 		 558 aa  181  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  33.58 
 
 		 542 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  28.14 
 
 		 638 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.99 
 
 		 559 aa  179  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  27.84 
 
 		 644 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.78 
 
 		 637 aa  179  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  29.73 
 
 		 625 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.21 
 
 		 532 aa  179  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.13 
 
 		 561 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.2 
 
 		 555 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.89 
 
 		 578 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.46 
 
 		 705 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 		 555 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  36.47 
 
 		 551 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  29.73 
 
 		 625 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 		 555 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.78 
 
 		 637 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  29.78 
 
 		 637 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  29.78 
 
 		 637 aa  179  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.78 
 
 		 637 aa  179  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  28.36 
 
 		 636 aa  178  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  29.78 
 
 		 637 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  34.4 
 
 		 532 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.78 
 
 		 637 aa  179  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  30.34 
 
 		 635 aa  179  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15000  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.65 
 
 		 600 aa  179  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0302703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  25.99 
 
 		 645 aa  179  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.78 
 
 		 637 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.78 
 
 		 637 aa  179  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  29.21 
 
 		 667 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  27.21 
 
 		 643 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2713  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.73 
 
 		 555 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.93 
 
 		 559 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  29.8 
 
 		 653 aa  178  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  34.52 
 
 		 537 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0037  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.02 
 
 		 555 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264543  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  28.47 
 
 		 637 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>