More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4120 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4120  ABC transporter related protein  100 
 
 		 325 aa  644    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  45.94 
 
 		 409 aa  228  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  44.9 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  40.5 
 
 		 389 aa  206  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  39.6 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4755  ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  41.28 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5295  ABC transporter related  41.52 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.569145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.71 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7061  ABC transporter related  34.77 
 
 		 297 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  42.02 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  32.34 
 
 		 299 aa  192  9e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.03 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  39.47 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  38.41 
 
 		 315 aa  188  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.95 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  38.94 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  40.53 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  38.11 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  33.33 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  37.71 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  49.75 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  52 
 
 		 398 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  42.45 
 
 		 303 aa  185  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  39.46 
 
 		 304 aa  185  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.45 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  42.45 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  41.25 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  42.45 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  42.45 
 
 		 303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  38.26 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  37.92 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  40.53 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  45.69 
 
 		 301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  41.51 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  39.46 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  43.62 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  38.46 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  38.8 
 
 		 355 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  41.71 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  38.03 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  39.4 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  40.33 
 
 		 373 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  42.73 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  47.8 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.04 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  49.27 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  40.22 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.66 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  39.6 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  44.7 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  38.26 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  39.47 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  41.28 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  38.74 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.41 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  41.63 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  42.27 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  42.27 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  42.27 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  48.83 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  42.51 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  37.63 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 305 aa  175  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  46.34 
 
 		 303 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.13 
 
 		 247 aa  175  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  33.33 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  49 
 
 		 313 aa  175  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  44.5 
 
 		 304 aa  175  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  40.1 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  48.33 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  46.05 
 
 		 242 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  39.41 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  32.69 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  42.99 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  47.6 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  47.87 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  37.95 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  45.79 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  42.19 
 
 		 304 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  39.53 
 
 		 300 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  44.25 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  38.21 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  36.31 
 
 		 457 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  38.53 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03750  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.9 
 
 		 237 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.591537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>