More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3896 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 477 aa  970    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  53.48 
 
 		 473 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  51.19 
 
 		 476 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  36.64 
 
 		 462 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  35.39 
 
 		 448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  35.9 
 
 		 543 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  35.35 
 
 		 574 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  34.4 
 
 		 437 aa  202  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  34.29 
 
 		 440 aa  190  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  33.49 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  31.51 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  31.44 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  32.07 
 
 		 436 aa  183  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  34.08 
 
 		 443 aa  183  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  32.58 
 
 		 452 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  33.94 
 
 		 481 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  30.97 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  42.26 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  31.15 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  32.13 
 
 		 451 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  31.21 
 
 		 455 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  32.72 
 
 		 448 aa  172  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  33.03 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  33.26 
 
 		 450 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  29.84 
 
 		 453 aa  167  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  33.06 
 
 		 445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  32.93 
 
 		 454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  32.63 
 
 		 470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  30.63 
 
 		 461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  32.78 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  32.78 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  33.02 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  30.03 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  32.12 
 
 		 466 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  39.31 
 
 		 556 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  33.23 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  35.76 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  31.72 
 
 		 447 aa  158  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  32.27 
 
 		 469 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  29.84 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  29.14 
 
 		 445 aa  156  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  34.77 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  29.09 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33 
 
 		 555 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  32.05 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86278  predicted protein  32.09 
 
 		 620 aa  153  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  30.59 
 
 		 485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  30.71 
 
 		 456 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  28.41 
 
 		 433 aa  152  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  29.74 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  28.34 
 
 		 433 aa  151  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  31.28 
 
 		 565 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  31.63 
 
 		 483 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  33.12 
 
 		 441 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  33.42 
 
 		 454 aa  149  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  34.25 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  34.8 
 
 		 557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  30.18 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  33.33 
 
 		 578 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  28.35 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  28.53 
 
 		 453 aa  147  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.87 
 
 		 554 aa  146  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  28.1 
 
 		 456 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  30.13 
 
 		 619 aa  146  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  38.7 
 
 		 556 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18521  hypothetical protein  32.69 
 
 		 616 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0520951  normal  0.0416558 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  31.51 
 
 		 562 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  31.51 
 
 		 562 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  31.15 
 
 		 619 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19051  hypothetical protein  30.77 
 
 		 618 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.21 
 
 		 530 aa  141  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  30.53 
 
 		 619 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30211  putative protein kinase:ABC1 family  32.92 
 
 		 629 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.286436 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19231  hypothetical protein  31.35 
 
 		 618 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.494256  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  26.67 
 
 		 440 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  27.97 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1806  putative protein kinase:ABC1 family  31.48 
 
 		 618 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  27.48 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  32.2 
 
 		 585 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  31.02 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  34.77 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  34.77 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  32.11 
 
 		 561 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  33.91 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  31.33 
 
 		 576 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  26.92 
 
 		 433 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2256  ABC-1 domain protein  30.72 
 
 		 560 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.32 
 
 		 559 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  29.89 
 
 		 583 aa  137  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19041  hypothetical protein  30.94 
 
 		 618 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  26.44 
 
 		 440 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  34.47 
 
 		 562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  28.03 
 
 		 666 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  29.19 
 
 		 561 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  32.25 
 
 		 564 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  32.19 
 
 		 563 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  29.6 
 
 		 689 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  25.23 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3680  ABC-1 domain protein  31.09 
 
 		 670 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>