More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2519 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2519  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 121 aa  242  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3039  regulatory protein, ArsR  79.82 
 
 		 119 aa  190  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5737  ArsR family transcriptional regulator  78.7 
 
 		 108 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.303432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5359  ArsR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 108 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5449  ArsR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 108 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3317  regulatory protein, ArsR  70.83 
 
 		 118 aa  173  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0899623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30170  transcriptional regulator, ArsR family  61.74 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.758763  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  60.2 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.89 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  60.4 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.21 
 
 		 116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3252  regulatory protein ArsR  55.66 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0479  transcriptional regulator, ArsR family  56.31 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741609  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3553  regulatory protein, ArsR  56.7 
 
 		 110 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  40.43 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  39 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  38.32 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  36.89 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  39.56 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.59 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  40.48 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  36.04 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  35.92 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  33.03 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  29.52 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  28.97 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.52 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  27.45 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  35.51 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 330 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  26.88 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  33.03 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  48.33 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  31.37 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  33.62 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  35.35 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>