172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2312 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2312  protein of unknown function DUF885  100 
 
 		 555 aa  1106    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1960  protein of unknown function DUF885  54.11 
 
 		 542 aa  521  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  52.55 
 
 		 547 aa  511  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1015  protein of unknown function DUF885  50.63 
 
 		 565 aa  505  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  50.98 
 
 		 577 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3789  hypothetical protein  52.29 
 
 		 544 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0847  protein of unknown function DUF885  48.84 
 
 		 567 aa  497  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.327552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  49.47 
 
 		 561 aa  494  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  48.5 
 
 		 568 aa  489  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2303  hypothetical protein  51.18 
 
 		 549 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2350  hypothetical protein  51.18 
 
 		 549 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2342  hypothetical protein  50.64 
 
 		 549 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.813286  decreased coverage  0.0014283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1038  protein of unknown function DUF885  49.38 
 
 		 565 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  47.01 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21140  hypothetical protein  47.2 
 
 		 563 aa  442  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.316254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1279  hypothetical protein  46.25 
 
 		 561 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  44.39 
 
 		 559 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3910  protein of unknown function DUF885  47.91 
 
 		 548 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.607477  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2230  hypothetical protein  42.29 
 
 		 560 aa  419  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531151  decreased coverage  0.00593781 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1323  protein of unknown function DUF885  46.04 
 
 		 561 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000137571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0235  hypothetical protein  43.17 
 
 		 560 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0216  hypothetical protein  43.66 
 
 		 556 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166769  normal  0.0154007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27920  hypothetical protein  43.32 
 
 		 558 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.595519  normal  0.0193184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0196  hypothetical protein  43.48 
 
 		 556 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.825624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  43.91 
 
 		 559 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3944  protein of unknown function DUF885  40.6 
 
 		 575 aa  359  7e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  41.06 
 
 		 543 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0156  protein of unknown function DUF885  37.41 
 
 		 555 aa  298  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1203  protein of unknown function DUF885  38.56 
 
 		 537 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.766483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4632  protein of unknown function DUF885  37.81 
 
 		 561 aa  260  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  28.45 
 
 		 611 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  28.35 
 
 		 614 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  27.66 
 
 		 614 aa  150  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  27.48 
 
 		 607 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  27.48 
 
 		 607 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  28.17 
 
 		 614 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  27.48 
 
 		 607 aa  150  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  27.64 
 
 		 614 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  27.82 
 
 		 617 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  32.21 
 
 		 593 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  24.38 
 
 		 1283 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  34.82 
 
 		 608 aa  137  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  30.18 
 
 		 599 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  29.04 
 
 		 621 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  35.65 
 
 		 227 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  24.36 
 
 		 617 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  28.46 
 
 		 611 aa  134  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  29.51 
 
 		 635 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  30.37 
 
 		 609 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  26.14 
 
 		 551 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  28.33 
 
 		 635 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  28.51 
 
 		 566 aa  130  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  29.56 
 
 		 635 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  24.29 
 
 		 622 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  28.06 
 
 		 628 aa  129  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  30.65 
 
 		 639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  27.27 
 
 		 593 aa  126  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  27.88 
 
 		 547 aa  126  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  27.84 
 
 		 595 aa  126  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  30.9 
 
 		 598 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  23.3 
 
 		 618 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  25.52 
 
 		 610 aa  124  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  30.09 
 
 		 619 aa  124  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  23.89 
 
 		 585 aa  123  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  28.25 
 
 		 605 aa  123  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  31.49 
 
 		 621 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  23.13 
 
 		 602 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  27.52 
 
 		 599 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  26.76 
 
 		 609 aa  122  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  28.22 
 
 		 599 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  28.85 
 
 		 601 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  26.93 
 
 		 602 aa  120  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  28.45 
 
 		 601 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  28.73 
 
 		 605 aa  120  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  28.45 
 
 		 601 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  28.05 
 
 		 608 aa  120  9e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  29.48 
 
 		 601 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  24.92 
 
 		 630 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  27.91 
 
 		 591 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  28.32 
 
 		 610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  29.73 
 
 		 590 aa  118  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  27.88 
 
 		 608 aa  118  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  28.25 
 
 		 616 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  26.42 
 
 		 625 aa  117  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  28.13 
 
 		 603 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  28.13 
 
 		 603 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  28.13 
 
 		 603 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  28.13 
 
 		 603 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  28.88 
 
 		 594 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  30.09 
 
 		 629 aa  116  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  27.1 
 
 		 611 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  27.62 
 
 		 619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  30.72 
 
 		 604 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  27.42 
 
 		 609 aa  115  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  27.1 
 
 		 609 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  27.74 
 
 		 609 aa  115  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  27.74 
 
 		 609 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  28.9 
 
 		 616 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  27.1 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  38.53 
 
 		 546 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>