265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2177 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  100 
 
 		 168 aa  335  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  53.12 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  51.85 
 
 		 161 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  51.23 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  51.23 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  50.94 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  52.44 
 
 		 171 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  51.57 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  48.45 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  48.81 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  48.24 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  50.36 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 163 aa  134  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  44.64 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  44 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  45.4 
 
 		 176 aa  124  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  44.24 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  42.69 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 292 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  42.14 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  42.59 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  48.2 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  37.36 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  37.36 
 
 		 194 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  39.62 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  41.61 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  40.76 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  40.51 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  39.87 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  39.87 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  40.83 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  39.11 
 
 		 220 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  39.87 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  43.38 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  40.72 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  37.65 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  39.63 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  38.79 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  41.42 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  43.06 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  42.01 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  40.11 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  37.65 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  37.27 
 
 		 161 aa  108  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  38.82 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  43.01 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 		 166 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  35.76 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  38.52 
 
 		 155 aa  107  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  37.97 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  41.06 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  39.87 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  40.67 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  36.97 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  36.97 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  32.93 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  41.07 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  40.83 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  34.57 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  45.52 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  34.57 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  39.6 
 
 		 170 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  37.36 
 
 		 169 aa  104  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  41.38 
 
 		 172 aa  103  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  41.07 
 
 		 178 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  36.54 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  40 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  40.65 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  42.61 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  37.18 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1728  dihydrofolate reductase  44.06 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  40 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0847  dihydrofolate reductase  47.48 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>