280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3237 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  60 
 
 		 235 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  42.8 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  45.34 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  44.92 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  44.49 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  41.95 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  41.53 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  49.47 
 
 		 190 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  49.47 
 
 		 190 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  47.89 
 
 		 190 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  45.26 
 
 		 190 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  46.32 
 
 		 190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.55 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1189  amidophosphoribosyltransferase  35.96 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  36.09 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  32.9 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0407  late competence protein  33.04 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00143489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  30.62 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1333  amidophosphoribosyltransferase  31.19 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000118049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  31.65 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  35.21 
 
 		 259 aa  95.5  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 276 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  30 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  34.32 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.57 
 
 		 233 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  33.9 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  35.57 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.52 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  32.89 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  28.64 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  28.1 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0775  hypothetical protein  29.61 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.572704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0792  hypothetical protein  29.61 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0624142  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  27.62 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  29.17 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  42.86 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  30.09 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0418  comF operon protein 3  34.23 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  30.05 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  30.97 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.4 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  48.21 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.5 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  33.33 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.05 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.95 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  32.08 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  29.61 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  31.44 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  31.78 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  29.55 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  30.04 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  29.13 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  27.1 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  24.88 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  26.81 
 
 		 247 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  27.36 
 
 		 244 aa  72  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  26.56 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  29.38 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2857  phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1671  ComF family protein  35.76 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  24.88 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  28.84 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  30 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  29.3 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  23.86 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  23.86 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  28.14 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  24.4 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  41.18 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  27.93 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  26.97 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  31.48 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  34.82 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1648  phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  30.65 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  27.83 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  31.1 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  28.77 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  31.82 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  28.04 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  27.4 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>