41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3452 on replicon NC_012794
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  100 
 
 		 381 aa  768    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  75.32 
 
 		 383 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  41.8 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  43.78 
 
 		 320 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  29.49 
 
 		 409 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  33.8 
 
 		 230 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  31.78 
 
 		 323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  30.73 
 
 		 219 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  31.63 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  30.09 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  31.19 
 
 		 315 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  26.82 
 
 		 251 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  26.82 
 
 		 251 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  28.27 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  28.98 
 
 		 342 aa  93.2  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  27.19 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  27.23 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  28.1 
 
 		 336 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  27.85 
 
 		 354 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  27.55 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  31.21 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  28.7 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  24.88 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  25.87 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  25.36 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  23.94 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7051  initiator RepB protein  27.6 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  23.29 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  22.96 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  27.27 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0022  truncated replication protein  29.09 
 
 		 214 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  24.55 
 
 		 433 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7035  initiator RepB protein  25.71 
 
 		 317 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  25.54 
 
 		 438 aa  47  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0794  replication initiation and membrane attachment family protein  52 
 
 		 461 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  25.54 
 
 		 438 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  23.28 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2994  primosome, DnaD subunit  59.57 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3700  initiator RepB protein  23.53 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000306619  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  20.82 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0015  replication initation protein Pi  23.14 
 
 		 290 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>