More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0144 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 145 aa  299  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  94.48 
 
 		 145 aa  290  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  84.83 
 
 		 145 aa  258  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  84.14 
 
 		 145 aa  254  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  84.14 
 
 		 145 aa  254  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  84.14 
 
 		 145 aa  254  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  84.14 
 
 		 145 aa  254  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  84.14 
 
 		 145 aa  254  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  84.14 
 
 		 145 aa  254  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  84.14 
 
 		 145 aa  254  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  82.76 
 
 		 145 aa  253  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  82.76 
 
 		 145 aa  252  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  82.76 
 
 		 145 aa  250  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  69.29 
 
 		 142 aa  203  6e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  64.83 
 
 		 145 aa  202  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  64.83 
 
 		 145 aa  202  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  65.52 
 
 		 145 aa  201  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 		 143 aa  200  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  66.43 
 
 		 144 aa  197  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  67.13 
 
 		 145 aa  195  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 144 aa  194  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  65.94 
 
 		 148 aa  194  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  63.83 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  63.83 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  63.64 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2679  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 144 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200743  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2364  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 144 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000697609  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  65.52 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 147 aa  190  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  61.81 
 
 		 147 aa  190  6e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  61.43 
 
 		 148 aa  185  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 149 aa  184  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 149 aa  184  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 142 aa  183  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  63.7 
 
 		 150 aa  183  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  57.93 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  60.74 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  62.96 
 
 		 147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 149 aa  179  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 150 aa  179  9.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 151 aa  179  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  58.52 
 
 		 149 aa  179  9.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 151 aa  179  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 150 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  59.29 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 147 aa  176  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 154 aa  176  9e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  60 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 159 aa  174  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0663  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.131584  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  54.41 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  55.88 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  173  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  173  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 147 aa  174  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>