50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1458 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1458  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 524 aa  1061    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.726847  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 626 aa  55.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 886 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 878 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0206  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 		 345 aa  52  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.45 
 
 		 810 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 		 767 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.77 
 
 		 725 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 591 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 250 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 718 aa  50.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 593 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3446  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 234 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 573 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 614 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.03 
 
 		 676 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3510  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 234 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.429554  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 620 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 543 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 614 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.38 
 
 		 626 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.22 
 
 		 1979 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  34.13 
 
 		 634 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 886 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 374 aa  47.4  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3364  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 234 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.51 
 
 		 358 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.32 
 
 		 620 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 688 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 249 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.05 
 
 		 1737 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 1450 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 637 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.58 
 
 		 742 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.02 
 
 		 3172 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 448 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 635 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.23 
 
 		 602 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 635 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.73 
 
 		 267 aa  44.3  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.13 
 
 		 632 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  35.71 
 
 		 1265 aa  44.3  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0341  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 752 aa  44.3  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 274 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 827 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 4079 aa  44.3  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.81 
 
 		 883 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 636 aa  43.9  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 468 aa  43.9  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>