49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0988 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  100 
 
 		 677 aa  1340    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  31.96 
 
 		 692 aa  318  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  32.51 
 
 		 649 aa  279  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  35.48 
 
 		 651 aa  259  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  31.41 
 
 		 656 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  33.19 
 
 		 647 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  30.98 
 
 		 644 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  32.37 
 
 		 676 aa  229  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  32.91 
 
 		 649 aa  226  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  30.8 
 
 		 650 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  32.29 
 
 		 653 aa  223  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  30.92 
 
 		 647 aa  221  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  31.4 
 
 		 676 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  31 
 
 		 652 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  30.41 
 
 		 650 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  27.91 
 
 		 737 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1008 aa  177  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1203 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  30.62 
 
 		 730 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  32.88 
 
 		 1119 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  36.76 
 
 		 706 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  25.88 
 
 		 785 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  34.75 
 
 		 796 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1080 aa  128  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1101 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  33.9 
 
 		 760 aa  115  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  28.52 
 
 		 469 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  28.19 
 
 		 469 aa  99.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  28.09 
 
 		 469 aa  99  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  42.22 
 
 		 854 aa  92.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  42.86 
 
 		 843 aa  87.4  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1183 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  51.39 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  30.31 
 
 		 503 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1168 aa  70.9  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  30.74 
 
 		 503 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1088 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  29.79 
 
 		 833 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  27.85 
 
 		 957 aa  63.9  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  30.95 
 
 		 986 aa  63.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1236 aa  60.8  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1235 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  33.33 
 
 		 833 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1022 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  28.44 
 
 		 1744 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  26.67 
 
 		 814 aa  48.9  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  32.8 
 
 		 939 aa  48.1  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1246 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1289 aa  45.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>