More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2556 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  100 
 
 		 305 aa  622  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  98.69 
 
 		 305 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  79.8 
 
 		 304 aa  511  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  79.28 
 
 		 313 aa  510  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  79.14 
 
 		 305 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  72.61 
 
 		 305 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  71.8 
 
 		 305 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  63 
 
 		 314 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  63 
 
 		 314 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  61.67 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  61.33 
 
 		 313 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  55.45 
 
 		 303 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  54 
 
 		 303 aa  352  5e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  52.81 
 
 		 303 aa  350  1e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  53.97 
 
 		 303 aa  348  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  54.33 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  53.18 
 
 		 303 aa  346  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  52.98 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  52.84 
 
 		 303 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  52.49 
 
 		 307 aa  332  4e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  52.63 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  52.27 
 
 		 308 aa  326  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  52.48 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  51.49 
 
 		 305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  50.67 
 
 		 307 aa  311  9e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  49.83 
 
 		 308 aa  311  9e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  50 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  48.01 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  46.51 
 
 		 308 aa  298  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  47.68 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  46.36 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  42.42 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  41.61 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  30.65 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  25.78 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  24.11 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  32.19 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  30.59 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  26.28 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  25.91 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  34.35 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  34.35 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  34.35 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  34.35 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  34.35 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.19 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.19 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.19 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.19 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  37.5 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  32.45 
 
 		 404 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  26.09 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  28.11 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.19 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  29.86 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  34.45 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  25.6 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  28.17 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  28.17 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  28.74 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  23.68 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  26.44 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  30.28 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  25.6 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  26.44 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  32.46 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  21.64 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  27.91 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  38.05 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  42.68 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.72 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  34.75 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  35.29 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  26.57 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  25.81 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  33.88 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  37.78 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  39.22 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  25 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  25.48 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01919  pfkB family carbohydrate kinase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_4G09500)  26.56 
 
 		 467 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0083327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  26.37 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  26.67 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  22.93 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  24.05 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  32.48 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  30.22 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  32.97 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  31.62 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  28.47 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  28.67 
 
 		 642 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  28.47 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 		 360 aa  53.9  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  21.2 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  31.91 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  34.48 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.06 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  28.46 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  22.96 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  32.41 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>