More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2550 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2550  response regulator receiver protein  100 
 
 		 135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35149e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1663  response regulator receiver protein  96.3 
 
 		 135 aa  260  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2931  response regulator receiver protein  66.4 
 
 		 134 aa  174  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1120  response regulator  61.24 
 
 		 134 aa  163  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3600  response regulator receiver protein  61.42 
 
 		 134 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0438  response regulator receiver protein  61.42 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.186072  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.92 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.28 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.26 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1571  response regulator receiver domain-containing protein  39.52 
 
 		 369 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.421164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4891  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.78 
 
 		 249 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.29 
 
 		 318 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  41.9 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  28.24 
 
 		 233 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  35.16 
 
 		 236 aa  64.3  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 229 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03240  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.2 
 
 		 229 aa  63.9  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  32.23 
 
 		 261 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.86 
 
 		 240 aa  63.5  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  30.89 
 
 		 242 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.08 
 
 		 227 aa  63.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  30.89 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.89 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  40.96 
 
 		 803 aa  63.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 777 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.19 
 
 		 916 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.43 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  29.69 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 		 1101 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  28.35 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.86 
 
 		 703 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1042  two component signal transduction response regulator  31.4 
 
 		 465 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.51 
 
 		 473 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  30.89 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.23 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  30.89 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1380  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.13 
 
 		 454 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00781234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3452  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 226 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 576 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  38.75 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  38.75 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 911 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3097  diguanylate cyclase  30.89 
 
 		 458 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.948135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.75 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  33.77 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  31.71 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3647  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 471 aa  60.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  31.71 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  31.15 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  31.71 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  31.71 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  31.71 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  31.71 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  31.71 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  31.71 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2665  transcriptional regulator, XRE family  33.61 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000943632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  31.71 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  31.71 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 410 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  31.71 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  31.01 
 
 		 257 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  40 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1768 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1649  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 236 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.4 
 
 		 367 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  34.11 
 
 		 245 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  37.5 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 		 241 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 239 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1165  diguanylate cyclase  30.08 
 
 		 459 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000192138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.42 
 
 		 448 aa  60.1  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.78 
 
 		 310 aa  60.1  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3036  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697745  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  32.81 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1147  response regulator receiver protein  35.63 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  37.5 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  30.16 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.25 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103678  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  28.69 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.27 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02792  response regulator  29.41 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.27 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>