191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0540 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  100 
 
 
154 aa  310  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  92.86 
 
 
154 aa  275  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  57.82 
 
 
149 aa  176  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  59.31 
 
 
146 aa  170  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  47.97 
 
 
152 aa  141  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  49.67 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  46.88 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  50.33 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  47.79 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  47.1 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  49.01 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  46.38 
 
 
145 aa  103  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  41.1 
 
 
144 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  41.78 
 
 
144 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  41.78 
 
 
144 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  39.73 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  44.62 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  41.1 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  39.04 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  38.03 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  37.5 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  40.56 
 
 
144 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  40.85 
 
 
145 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  40.77 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  40.85 
 
 
145 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  40.14 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  45.65 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  39.72 
 
 
146 aa  86.3  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  40.56 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  36.81 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.17 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  41.78 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  43.45 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  41.78 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  40.56 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  37.33 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  43.41 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  40.94 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  42.11 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  43.84 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  33.56 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  34.25 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  37.68 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  34.25 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  34.25 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  35.62 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  34.51 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  38.24 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  34.97 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  42.54 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  34.97 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  34.97 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  35.46 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  36.84 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  36.09 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  39.26 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  37.68 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  37.68 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  37.68 
 
 
173 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  35.46 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  31.91 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  33.09 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  32.21 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  39.6 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  35.77 
 
 
239 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  34.75 
 
 
378 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  36.69 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  46.67 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  28.89 
 
 
296 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  35.56 
 
 
127 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  36.09 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  32.61 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  38.46 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  37.61 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  37.61 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  37.61 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  37.61 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  28.81 
 
 
196 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  37.61 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  37.61 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  33.33 
 
 
177 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  33.1 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  32.98 
 
 
196 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  34.53 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  33.33 
 
 
177 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  33.1 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  37.61 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  33.1 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  33.64 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  33.64 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  39.85 
 
 
197 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  33.68 
 
 
197 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  32.63 
 
 
216 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  37.61 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  30.94 
 
 
180 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  28.19 
 
 
279 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  31.21 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  31.34 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  33.08 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>