More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6561 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 349 aa  710    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  84.68 
 
 		 346 aa  599  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.72 
 
 		 346 aa  444  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.13 
 
 		 349 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.65 
 
 		 350 aa  427  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.68 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.65 
 
 		 338 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  53.53 
 
 		 353 aa  361  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55 
 
 		 353 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.49 
 
 		 342 aa  358  7e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  52.06 
 
 		 347 aa  339  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.92 
 
 		 340 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  50.44 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.75 
 
 		 342 aa  319  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.45 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.56 
 
 		 342 aa  301  8.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.86 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.83 
 
 		 347 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  43.33 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.61 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.51 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.36 
 
 		 351 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  43.4 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.52 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.6 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.85 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  38.37 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  33.84 
 
 		 346 aa  199  5e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.84 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.93 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.79 
 
 		 342 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.76 
 
 		 510 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.1 
 
 		 724 aa  192  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 459 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 		 312 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  34.1 
 
 		 352 aa  185  9e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.87 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.25 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  35.58 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.95 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.22 
 
 		 315 aa  156  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.63 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 		 325 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 		 327 aa  126  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.06 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  29.45 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  29.13 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 319 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  35.29 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  35.29 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  33.75 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 		 310 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 		 310 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  30.32 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  30.32 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  28.25 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  32.09 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  29.97 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  32.36 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  29.39 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  34.2 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 		 303 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  33.71 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  30.63 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  29.82 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  30.06 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2838  UDP-glucose 4-epimerase  30.17 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  30.63 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  30.63 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  29.22 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  30.57 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  31.69 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.62 
 
 		 298 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  33.09 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  31.65 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  32.36 
 
 		 337 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  32.96 
 
 		 338 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.7 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  28.78 
 
 		 338 aa  99.4  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  33.46 
 
 		 338 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>