140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5737 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  48.25 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  46.49 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  44.27 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  53.06 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  44.83 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  41.32 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  48.67 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  50 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 166 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  46.09 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  48.67 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  46.43 
 
 		 127 aa  93.6  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 120 aa  93.2  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  49.49 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 185 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 141 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  48.04 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  43.93 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  42.74 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  41.13 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  46.55 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  43.36 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  41.13 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  40.54 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  40.54 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  41.44 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  40.3 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  39.34 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  42.74 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  42.2 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  40.35 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  50 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  36 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  44.19 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  39.13 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  35.51 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2840  CopY family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.941683  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  43.59 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  33.59 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  36.28 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  36.28 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  31.46 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  30.34 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  41.98 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  50 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  33.64 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  35.14 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  35.14 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  35.14 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  35.14 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  30.23 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  35.14 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  34.67 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  35.14 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  30.3 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  35.14 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  35.14 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  31.4 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  26.4 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  32.46 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  32.74 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  31.4 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5280  CopY family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219064  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  39.39 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  28.8 
 
 		 127 aa  52  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>