110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4044 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4044  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  156  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489915  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.5 
 
 		 248 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.806898  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.72 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 250 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.328906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 		 248 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 		 258 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00507501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 		 257 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 		 252 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.870685  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 252 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  34.33 
 
 		 242 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 		 248 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 238 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 		 248 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 250 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.147758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 		 247 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 		 259 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0259011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10840  putative dehydrogenase  48.28 
 
 		 250 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000391035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 		 255 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.843425  normal  0.851299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 285 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 228 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0331408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.06 
 
 		 260 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 274 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 		 229 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 255 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0691518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 		 241 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8773  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 		 261 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.17 
 
 		 233 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  31.34 
 
 		 294 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  31.34 
 
 		 294 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 226 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  31.34 
 
 		 291 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.28 
 
 		 264 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 		 247 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 		 246 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2147  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.86 
 
 		 253 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.760058  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 		 246 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0818672  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 260 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  32.31 
 
 		 286 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0914  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 250 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 267 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 250 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.331162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 245 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 285 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 		 248 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 		 248 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1443  short chain dehydrogenase  31.34 
 
 		 266 aa  42  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0586031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  38.24 
 
 		 251 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 		 269 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 284 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 248 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000317715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  37.5 
 
 		 245 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1991  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.84 
 
 		 251 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  36.84 
 
 		 283 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1390  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.84 
 
 		 251 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 248 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1014  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.84 
 
 		 251 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1302  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.84 
 
 		 251 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3172  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.84 
 
 		 251 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3043  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.84 
 
 		 251 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2278  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.84 
 
 		 251 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 		 259 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 245 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 		 246 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 336 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 		 248 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 		 291 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60014  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3571  short chain dehydrogenase  35.9 
 
 		 256 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0445953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 235 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 284 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3492  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 256 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.79 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 271 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 249 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 		 261 aa  41.2  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0249  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.29 
 
 		 258 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0279472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  31.34 
 
 		 298 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  33.33 
 
 		 260 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1106  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 		 256 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179926  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 		 250 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 		 284 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  36.84 
 
 		 283 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5492  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 263 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 		 260 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 		 226 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 		 247 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 264 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.221391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 		 276 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>