More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2452 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
223 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  85.2 
 
 
223 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  74.44 
 
 
223 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  56.02 
 
 
220 aa  254  8e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.94 
 
 
220 aa  240  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.42 
 
 
225 aa  234  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.92 
 
 
225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0984  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.09 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1789  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.09 
 
 
235 aa  174  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
236 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00829683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4460  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 
268 aa  121  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01710  putative enoyl-CoA hydratase  27.6 
 
 
238 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.14 
 
 
238 aa  108  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000198349  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06767  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14850)  28.14 
 
 
244 aa  89.4  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.761527  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06210  conserved hypothetical protein  29.36 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.7 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.57 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.75 
 
 
695 aa  72  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.85 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.82 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.27 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.61 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  25.82 
 
 
275 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  28.12 
 
 
261 aa  62  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  29.03 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  31.14 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.42 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.3 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  28.43 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  29.94 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  29.77 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  30.54 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  27.84 
 
 
258 aa  58.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  26.76 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4169  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.86 
 
 
280 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.37 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4679  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  23.91 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.29 
 
 
279 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  24.61 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04074  conserved hypothetical protein  23.91 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2829  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.44 
 
 
265 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.91 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  26.32 
 
 
229 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04036  hypothetical protein  23.91 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.13651  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  26.64 
 
 
275 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3658  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  29.31 
 
 
271 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551488  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  29.19 
 
 
264 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4452  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  23.37 
 
 
258 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202133  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0459  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  26.6 
 
 
248 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0261  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.31 
 
 
729 aa  55.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.86607  normal  0.0441662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2737  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.93 
 
 
282 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1216  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  26.6 
 
 
260 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2611  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  26.6 
 
 
260 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.285185  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  26.76 
 
 
275 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.84 
 
 
259 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1116  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  26.6 
 
 
260 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0703433  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1382  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  26.6 
 
 
260 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.465754  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4743  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  23.37 
 
 
258 aa  55.5  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0219065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0183  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  26.6 
 
 
260 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260328  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1468  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  26.6 
 
 
260 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0875156  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  26.7 
 
 
265 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4769  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  23.91 
 
 
258 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.75 
 
 
292 aa  55.1  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  27.23 
 
 
229 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  26.26 
 
 
262 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1456  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.21 
 
 
279 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  30.82 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1671  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.026976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 
267 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.23 
 
 
266 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  26.07 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.56 
 
 
283 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  30.3 
 
 
288 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  24.56 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  22.54 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  27.32 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  27.23 
 
 
229 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1601  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  25.58 
 
 
262 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  26.6 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  27.56 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  31.67 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.33 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.4 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.89 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504232  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  26.5 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  27.83 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14440  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  24.73 
 
 
715 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2145  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  25 
 
 
715 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.09 
 
 
263 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.95 
 
 
266 aa  52.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4083  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.71 
 
 
251 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1912  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  24.46 
 
 
729 aa  52.8  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.539426  normal  0.0186555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3949  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  25.54 
 
 
729 aa  52.4  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.706953  normal  0.0634882 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0283  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  24.46 
 
 
729 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00882549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>