More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0935 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  56.13 
 
 		 682 aa  684    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  54.15 
 
 		 702 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  51.1 
 
 		 708 aa  664    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  54.81 
 
 		 689 aa  685    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  54.51 
 
 		 684 aa  640    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  51.22 
 
 		 709 aa  645    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  53.71 
 
 		 712 aa  682    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  55.54 
 
 		 674 aa  648    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  69.33 
 
 		 736 aa  956    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  54.08 
 
 		 707 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  52.71 
 
 		 717 aa  676    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  51.79 
 
 		 787 aa  670    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  53.06 
 
 		 726 aa  668    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 759 aa  1483    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  54.22 
 
 		 694 aa  636    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  53.24 
 
 		 710 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  50.82 
 
 		 697 aa  648    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  52.22 
 
 		 701 aa  652    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  54.83 
 
 		 719 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  51.88 
 
 		 700 aa  627  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  53.94 
 
 		 714 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  53.94 
 
 		 707 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  53.94 
 
 		 707 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  53.88 
 
 		 685 aa  617  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  54.33 
 
 		 719 aa  617  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  52.14 
 
 		 697 aa  614  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  51.91 
 
 		 688 aa  614  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.69 
 
 		 699 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  49.87 
 
 		 717 aa  598  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  49.66 
 
 		 704 aa  600  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  51.89 
 
 		 685 aa  579  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  50.62 
 
 		 670 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  45.99 
 
 		 710 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  45.75 
 
 		 690 aa  528  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  61.23 
 
 		 876 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  46.5 
 
 		 643 aa  405  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  45.41 
 
 		 508 aa  299  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  29.63 
 
 		 689 aa  271  2e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  28.68 
 
 		 687 aa  265  3e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.32 
 
 		 838 aa  257  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.7 
 
 		 689 aa  254  4.0000000000000004e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.88 
 
 		 694 aa  253  7e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  35.29 
 
 		 659 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.57 
 
 		 742 aa  249  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.99 
 
 		 685 aa  249  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  30.13 
 
 		 678 aa  247  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.27 
 
 		 686 aa  246  9.999999999999999e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 714 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  31.53 
 
 		 744 aa  243  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.3 
 
 		 718 aa  239  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  34.42 
 
 		 515 aa  239  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  34.93 
 
 		 646 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  28.1 
 
 		 769 aa  237  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.96 
 
 		 748 aa  236  1.0000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  32.85 
 
 		 1232 aa  235  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  33.09 
 
 		 659 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  27.74 
 
 		 724 aa  234  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.71 
 
 		 737 aa  234  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.69 
 
 		 751 aa  232  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.69 
 
 		 751 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  31.59 
 
 		 620 aa  228  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.79 
 
 		 730 aa  226  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  29.66 
 
 		 735 aa  226  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.68 
 
 		 768 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.8 
 
 		 858 aa  226  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  31.82 
 
 		 745 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  36.73 
 
 		 739 aa  222  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  34.04 
 
 		 681 aa  221  3e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  34.97 
 
 		 768 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.25 
 
 		 762 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.48 
 
 		 754 aa  219  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.62 
 
 		 781 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.25 
 
 		 763 aa  219  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.73 
 
 		 794 aa  218  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  28.06 
 
 		 741 aa  218  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  34.96 
 
 		 731 aa  217  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  28.18 
 
 		 807 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.41 
 
 		 768 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.51 
 
 		 795 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.18 
 
 		 892 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1119  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.33 
 
 		 691 aa  216  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.76 
 
 		 773 aa  215  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.43 
 
 		 932 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  30.09 
 
 		 681 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1244  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.18 
 
 		 691 aa  214  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  34.96 
 
 		 732 aa  214  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  33.98 
 
 		 1032 aa  213  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  32.55 
 
 		 625 aa  213  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32 
 
 		 715 aa  213  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0621  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.33 
 
 		 691 aa  212  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.57 
 
 		 725 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  35.27 
 
 		 737 aa  211  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  32.18 
 
 		 816 aa  211  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.28 
 
 		 729 aa  211  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  28.94 
 
 		 816 aa  211  6e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  33.63 
 
 		 762 aa  210  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.97 
 
 		 831 aa  210  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.12 
 
 		 781 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  28.42 
 
 		 743 aa  210  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.88 
 
 		 797 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>