More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0357 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 303 aa  586  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  78.25 
 
 		 320 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  64.36 
 
 		 296 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  63.57 
 
 		 291 aa  363  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  61.03 
 
 		 291 aa  346  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  64.06 
 
 		 288 aa  338  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  63.29 
 
 		 307 aa  336  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  62.19 
 
 		 293 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  62.63 
 
 		 299 aa  331  8e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  61.59 
 
 		 299 aa  325  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  59.38 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  60.43 
 
 		 329 aa  319  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  55.97 
 
 		 300 aa  316  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  58.95 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  58.68 
 
 		 287 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  58.3 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  61.75 
 
 		 300 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  59.15 
 
 		 291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  57.8 
 
 		 288 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  57.8 
 
 		 288 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  57.8 
 
 		 288 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  54.64 
 
 		 304 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  56.74 
 
 		 303 aa  299  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  60.99 
 
 		 285 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  56.76 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  54.9 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  56.91 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  55.97 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  53.14 
 
 		 313 aa  275  8e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  56.07 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  56.25 
 
 		 335 aa  269  5e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  53.67 
 
 		 581 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  51.07 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  54.85 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  52.54 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  51.35 
 
 		 313 aa  255  7e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.73 
 
 		 331 aa  232  7.000000000000001e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  41.64 
 
 		 328 aa  219  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  39.73 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  39.14 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  38.1 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  44.29 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  43.06 
 
 		 373 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  39.36 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  40.49 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  40.54 
 
 		 363 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.69 
 
 		 361 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.21 
 
 		 363 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  38.7 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  39.15 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  38.26 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  37.55 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.59 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  36.36 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  37.62 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  38.46 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  42.93 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  42.31 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  36.44 
 
 		 354 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  37.12 
 
 		 341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  41.4 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  37.3 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  42.11 
 
 		 434 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  38.46 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.64 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4148  A/G-specific adenine glycosylase  36.28 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  35.56 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  34.75 
 
 		 353 aa  142  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  40.78 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  36.65 
 
 		 370 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  41.54 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  36.44 
 
 		 357 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.46 
 
 		 363 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  34.8 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.04 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.39 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.91 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  28.42 
 
 		 347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  35.86 
 
 		 381 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  35.85 
 
 		 401 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  36.96 
 
 		 419 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  36.89 
 
 		 350 aa  139  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  37.17 
 
 		 368 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  35.81 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  36.36 
 
 		 352 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  35.22 
 
 		 350 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  36.96 
 
 		 371 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  40.91 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  40.91 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  40.91 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  40.91 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  35.06 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  38.94 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  36.24 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  40.91 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  36.15 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  33.89 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  36.09 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  34.63 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>