66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0221 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  82.64 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  52.94 
 
 		 146 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  47.15 
 
 		 156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  51.3 
 
 		 140 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  49.57 
 
 		 142 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  49.57 
 
 		 142 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  41.98 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  42.86 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  46.22 
 
 		 155 aa  98.2  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  46.34 
 
 		 137 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4232  protein of unknown function DUF1469  55.46 
 
 		 145 aa  92.8  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  42.86 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  36 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  36.18 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  43.44 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  42.62 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  35.11 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  30.77 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  32.58 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  32.06 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  29.17 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  38.76 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  35.48 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  35.11 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  35.11 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  33.85 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  32.8 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  31.71 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  32.82 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  30.66 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  31.2 
 
 		 175 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  37.39 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  33.88 
 
 		 133 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  33.88 
 
 		 133 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  32.17 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  35 
 
 		 148 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  33.07 
 
 		 133 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  39.2 
 
 		 133 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  31.16 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  32.5 
 
 		 132 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  31.97 
 
 		 133 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  31.85 
 
 		 169 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  35 
 
 		 138 aa  48.5  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  37.63 
 
 		 158 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.113739 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  40.23 
 
 		 149 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  34.78 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  27.27 
 
 		 134 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  31.75 
 
 		 138 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  30.25 
 
 		 138 aa  45.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  37.39 
 
 		 137 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3054  hypothetical protein  34.55 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0916548  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  30.89 
 
 		 171 aa  44.7  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  32 
 
 		 170 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  32 
 
 		 170 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  32 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  36.23 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  33.04 
 
 		 131 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  38.1 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  28.06 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  35.42 
 
 		 157 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  32.23 
 
 		 155 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  34.09 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  28.87 
 
 		 139 aa  41.6  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  31.46 
 
 		 156 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  28.43 
 
 		 120 aa  41.6  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>