More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0203 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 237 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  50.68 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  43.71 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  43.44 
 
 		 289 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  39.86 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  39.34 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  40.82 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  38.89 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  41.84 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  38.52 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  35.14 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  38.89 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  34.9 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  34.9 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  41.26 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  34.9 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  42.45 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  37.72 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  36.5 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  42.03 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  38.1 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  39.62 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  36.09 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  40.38 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  38.35 
 
 		 584 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  36.96 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  34.97 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  40 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  39.25 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.82 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  36.84 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  37.59 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  37.96 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  32.39 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  36.3 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  37.14 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  36.57 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  31.69 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  48.61 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  27.45 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  37.5 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  41.9 
 
 		 276 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  37.24 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  35.96 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  35.29 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  35.04 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  36.17 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  35.34 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  35.34 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2748  NmrA family protein  39.04 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  39.09 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  34 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  38.46 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  35.14 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  36.57 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  30.07 
 
 		 332 aa  58.5  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  37.06 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  36.96 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  37.34 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  35.56 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.31 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.77 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1070  NmrA family protein  32.09 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.57 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  38.89 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  34.56 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.78 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  32.87 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  27.37 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  32.67 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  32.35 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  36.03 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  32.69 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  34.75 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3118  NmrA family protein  42.27 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  33.83 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  42.86 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  34.78 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.93 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  32.84 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.83 
 
 		 320 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  30.38 
 
 		 305 aa  54.3  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 		 306 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  28.4 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  35.77 
 
 		 513 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  36.23 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.78 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>