More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0846 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 235 aa  473  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  78.88 
 
 		 232 aa  382  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  73.48 
 
 		 233 aa  357  8e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  73.48 
 
 		 233 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  64.16 
 
 		 236 aa  297  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  60.62 
 
 		 231 aa  288  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  61.88 
 
 		 230 aa  286  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  56.58 
 
 		 235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  54.78 
 
 		 235 aa  265  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  57.21 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 242 aa  262  3e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  58.48 
 
 		 231 aa  262  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 236 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  57.47 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  55.8 
 
 		 230 aa  258  7e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 236 aa  257  9e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  55.75 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 234 aa  255  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  54.39 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  58.99 
 
 		 234 aa  254  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  58.99 
 
 		 234 aa  254  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  54.39 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  58.99 
 
 		 234 aa  254  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  58.44 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  58.53 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 231 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  51.97 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 235 aa  252  3e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  51.06 
 
 		 242 aa  251  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  58.44 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  50 
 
 		 242 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  52.84 
 
 		 230 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 237 aa  250  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  53.54 
 
 		 259 aa  250  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  55.61 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  53.07 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  53.48 
 
 		 230 aa  249  4e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  55.16 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  52.84 
 
 		 235 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  51.79 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  53.51 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  51.5 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  50.21 
 
 		 236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  52.68 
 
 		 236 aa  244  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  51.98 
 
 		 229 aa  244  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 235 aa  244  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0883  50S ribosomal protein L1  52.36 
 
 		 237 aa  243  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.184517  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  53.15 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  53.07 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 231 aa  242  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  51.75 
 
 		 231 aa  242  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  48.92 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  48.92 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 238 aa  241  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  50.87 
 
 		 230 aa  242  5e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 238 aa  241  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 235 aa  242  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  50.88 
 
 		 239 aa  241  6e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 238 aa  241  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  49.12 
 
 		 232 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 238 aa  241  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  52.42 
 
 		 233 aa  241  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  48.92 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  48.92 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  48.92 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0641  50S ribosomal protein L1  52.79 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>