More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4821 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 621 aa  1271    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2526  TonB-dependent receptor  40.88 
 
 		 620 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 639 aa  180  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2071  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 629 aa  167  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00162344  hitchhiker  0.000156466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  23.25 
 
 		 650 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 617 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  23.41 
 
 		 612 aa  114  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  22.24 
 
 		 633 aa  110  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  21.75 
 
 		 627 aa  110  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 619 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 602 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  21.99 
 
 		 597 aa  108  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  23.25 
 
 		 628 aa  107  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  24.05 
 
 		 593 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.72 
 
 		 619 aa  106  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  23.68 
 
 		 640 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  23.25 
 
 		 651 aa  105  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.94 
 
 		 623 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  22.84 
 
 		 634 aa  104  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  25.58 
 
 		 617 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 667 aa  100  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  23.14 
 
 		 665 aa  99.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.9 
 
 		 653 aa  99  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.25 
 
 		 666 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 634 aa  98.6  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  23.25 
 
 		 666 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  22.36 
 
 		 732 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.13 
 
 		 613 aa  97.8  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.08 
 
 		 666 aa  97.8  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.08 
 
 		 666 aa  97.4  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 614 aa  97.4  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 679 aa  97.1  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 653 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 634 aa  96.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  23.59 
 
 		 620 aa  95.9  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.37 
 
 		 666 aa  95.5  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23 
 
 		 631 aa  95.5  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  23.09 
 
 		 618 aa  94.7  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  23.31 
 
 		 611 aa  94.7  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  20.91 
 
 		 653 aa  94.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 613 aa  93.6  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 697 aa  93.6  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.52 
 
 		 614 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  23.3 
 
 		 645 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.56 
 
 		 614 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.34 
 
 		 631 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 616 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.4 
 
 		 614 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  20.39 
 
 		 649 aa  92  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.4 
 
 		 614 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.36 
 
 		 614 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  24.15 
 
 		 623 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  21.63 
 
 		 616 aa  90.9  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.84 
 
 		 631 aa  90.5  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.4 
 
 		 614 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  22.19 
 
 		 636 aa  90.1  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 621 aa  90.1  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  22.83 
 
 		 613 aa  90.1  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 681 aa  90.1  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.24 
 
 		 615 aa  89.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.43 
 
 		 646 aa  89.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 657 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  21.86 
 
 		 652 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 661 aa  89.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  24.18 
 
 		 702 aa  88.6  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  21.68 
 
 		 635 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 648 aa  87.4  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.74 
 
 		 631 aa  87.8  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  30.32 
 
 		 638 aa  86.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  22.96 
 
 		 622 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 649 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  20.99 
 
 		 615 aa  86.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 638 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  22.32 
 
 		 611 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.63 
 
 		 616 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 617 aa  85.5  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  22.2 
 
 		 611 aa  84.7  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 653 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  21.93 
 
 		 571 aa  84.3  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.83 
 
 		 614 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  20.4 
 
 		 624 aa  84  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 627 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.86 
 
 		 650 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  23.86 
 
 		 650 aa  84  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  23.56 
 
 		 650 aa  84  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 634 aa  84  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.66 
 
 		 650 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  20.75 
 
 		 631 aa  83.2  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.02 
 
 		 614 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  22.7 
 
 		 680 aa  83.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  22.57 
 
 		 628 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 640 aa  82.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 626 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  24.26 
 
 		 650 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  21.35 
 
 		 707 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 649 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  32.56 
 
 		 623 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 626 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.67 
 
 		 614 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  19.78 
 
 		 665 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>