More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4121 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  517  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.311135  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.69 
 
 
254 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.26 
 
 
257 aa  362  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.05 
 
 
260 aa  361  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.81 
 
 
257 aa  350  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.560297 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
258 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
252 aa  186  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
250 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
257 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
252 aa  178  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
251 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
254 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
256 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
255 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
272 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
247 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
247 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
255 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
255 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
248 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1466  short-chain alcohol dehydrogenase  42.23 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
252 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  39.44 
 
 
247 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2412  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  37.3 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1699  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  37.3 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
283 aa  162  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
262 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
252 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
246 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.86578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
256 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
244 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.372052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 
253 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
252 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
244 aa  158  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
246 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.8 
 
 
246 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
261 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
254 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
252 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
246 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
256 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 
253 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1604  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.85 
 
 
247 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
253 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
254 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933062  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
251 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
254 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699646  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
254 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
253 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
250 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
265 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
251 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
267 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
262 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365337 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
258 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
251 aa  155  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
257 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
248 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
246 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.368584  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
241 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.727774  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 
249 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
266 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.388787  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
256 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  37.3 
 
 
257 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1175  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.25 
 
 
241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267366  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0620  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.11 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 
251 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
254 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572061  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
254 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  36.54 
 
 
272 aa  152  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
255 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
247 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
250 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  35.06 
 
 
252 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.99 
 
 
246 aa  152  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
251 aa  152  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.65 
 
 
246 aa  151  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
250 aa  151  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
253 aa  151  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
253 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.11 
 
 
246 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  35.48 
 
 
260 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
271 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01741  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  33.47 
 
 
273 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.4 
 
 
249 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.11 
 
 
246 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
246 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
246 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>