90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1900 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1900  surface antigen (D15)  100 
 
 
772 aa  1573    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3472  surface antigen (D15)  44.53 
 
 
774 aa  634  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.151472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0735  surface antigen (D15)  41.69 
 
 
767 aa  619  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000801153  hitchhiker  0.00000000000164396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1223  outer membrane protein  37.78 
 
 
766 aa  529  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.760862  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6501  surface antigen (D15)  36.54 
 
 
808 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3196  surface antigen (D15)  36.09 
 
 
811 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03805  hypothetical protein  35.63 
 
 
762 aa  459  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1674  surface antigen (D15)  29.95 
 
 
810 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2095  putative lipoprotein  29.57 
 
 
775 aa  304  4.0000000000000003e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.544397 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1269  surface antigen (D15)  28.9 
 
 
769 aa  275  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.743361  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1917  outer membrane protein  28.76 
 
 
809 aa  244  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.220726 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12263  hypothetical protein  25.12 
 
 
853 aa  220  7e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.167756  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2726  surface antigen (D15)  27.04 
 
 
806 aa  220  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0992  surface antigen (D15)  24.91 
 
 
875 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4186  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0980  hypothetical protein  27.16 
 
 
745 aa  218  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1648  hypothetical protein  26.54 
 
 
780 aa  203  9e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1464  surface antigen (D15)  26.61 
 
 
851 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0452  surface antigen (D15)  24.38 
 
 
858 aa  194  8e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.150297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0537  surface antigen (D15)  25.67 
 
 
722 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0492  surface antigen (D15)  23.8 
 
 
761 aa  134  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0470  surface antigen (D15)  24.04 
 
 
730 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0652  surface antigen (D15)  25.08 
 
 
734 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.496085  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2555  surface antigen (D15)  24.12 
 
 
803 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0533  surface antigen (D15)  22.45 
 
 
743 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.885553  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1648  hypothetical protein  22.96 
 
 
725 aa  97.4  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0176  hypothetical protein  22.32 
 
 
741 aa  85.1  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  34.69 
 
 
665 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  31.06 
 
 
595 aa  57  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  32.92 
 
 
663 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  24.86 
 
 
961 aa  53.5  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  25.93 
 
 
622 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002754  outer membrane protein assembly factor YaeT precursor  28.67 
 
 
804 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604223  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  19.6 
 
 
673 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  25.31 
 
 
622 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03229  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.67 
 
 
804 aa  49.3  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  31.01 
 
 
661 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.16 
 
 
841 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  31.01 
 
 
661 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  28.66 
 
 
633 aa  48.5  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  26.99 
 
 
629 aa  48.9  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  31.68 
 
 
595 aa  48.9  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  29.41 
 
 
613 aa  48.5  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0335  surface antigen variable number repeat protein  36.73 
 
 
428 aa  48.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  26.38 
 
 
612 aa  48.1  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  23.26 
 
 
787 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  27.27 
 
 
786 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  21.1 
 
 
588 aa  48.1  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  25.26 
 
 
652 aa  47.8  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  28.93 
 
 
643 aa  47.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  30.72 
 
 
573 aa  47.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  23.39 
 
 
787 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  29.68 
 
 
611 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  31.21 
 
 
661 aa  47.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  26.51 
 
 
657 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.65 
 
 
895 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.88 
 
 
784 aa  46.6  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  29.63 
 
 
612 aa  46.6  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  34.88 
 
 
784 aa  46.6  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.8 
 
 
799 aa  47  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.66 
 
 
791 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  22.03 
 
 
610 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  28.83 
 
 
620 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  29.27 
 
 
765 aa  46.6  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  26.97 
 
 
571 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  22.5 
 
 
611 aa  45.8  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  29.53 
 
 
786 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  30.23 
 
 
647 aa  45.8  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  29.53 
 
 
786 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  26.97 
 
 
573 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  26.97 
 
 
573 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  25.3 
 
 
677 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01381  outer membrane protein, OMP85 family  25.5 
 
 
825 aa  45.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0183753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  26.97 
 
 
573 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  26.97 
 
 
605 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  25.3 
 
 
677 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  26.97 
 
 
605 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  23.27 
 
 
611 aa  45.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.83 
 
 
765 aa  45.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  28.22 
 
 
598 aa  44.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.53 
 
 
795 aa  44.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.53 
 
 
795 aa  44.7  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  25.81 
 
 
682 aa  44.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.53 
 
 
795 aa  44.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  29.03 
 
 
604 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.46 
 
 
772 aa  44.3  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  29.17 
 
 
696 aa  44.3  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  29.03 
 
 
604 aa  44.3  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  29.03 
 
 
604 aa  44.3  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  26.98 
 
 
768 aa  43.9  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  31.36 
 
 
843 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>