284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1109 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  60.32 
 
 		 512 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  70.24 
 
 		 511 aa  740    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  68.19 
 
 		 502 aa  714    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 506 aa  1038    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  57.31 
 
 		 513 aa  610  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  54.24 
 
 		 509 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  38.14 
 
 		 508 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  37.2 
 
 		 505 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  37.22 
 
 		 505 aa  324  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  37.52 
 
 		 505 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  37.33 
 
 		 505 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  37.33 
 
 		 505 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  37.33 
 
 		 505 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  37.33 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  37.33 
 
 		 505 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  37.33 
 
 		 505 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  36.6 
 
 		 505 aa  319  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  36.8 
 
 		 505 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  37.17 
 
 		 508 aa  318  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  37.18 
 
 		 516 aa  312  6.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  37.2 
 
 		 535 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  36.98 
 
 		 498 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  35.67 
 
 		 504 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  34.01 
 
 		 533 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  35.33 
 
 		 504 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  35.33 
 
 		 504 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  33.6 
 
 		 507 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  34.2 
 
 		 507 aa  293  7e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  32.09 
 
 		 523 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  33.67 
 
 		 510 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  31.7 
 
 		 523 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  34.13 
 
 		 540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  30.85 
 
 		 515 aa  283  7.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  33.13 
 
 		 516 aa  282  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  37.98 
 
 		 517 aa  282  9e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  32.51 
 
 		 509 aa  282  9e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  33.67 
 
 		 506 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  32.46 
 
 		 510 aa  279  8e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  34.71 
 
 		 520 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  33.67 
 
 		 511 aa  277  3e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  34.27 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  31.8 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  32.44 
 
 		 515 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  32.6 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  32.19 
 
 		 513 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  32.19 
 
 		 513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  32.19 
 
 		 513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  31.99 
 
 		 513 aa  274  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  31.67 
 
 		 510 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  32.19 
 
 		 513 aa  273  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  32.19 
 
 		 513 aa  273  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  32.19 
 
 		 513 aa  273  7e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  32.6 
 
 		 513 aa  272  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  32.67 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  35.22 
 
 		 505 aa  272  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  33.05 
 
 		 532 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  33.05 
 
 		 532 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  32.73 
 
 		 506 aa  269  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  35.84 
 
 		 511 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  36.17 
 
 		 489 aa  268  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  32.75 
 
 		 508 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  30.75 
 
 		 515 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  32.07 
 
 		 526 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  30.95 
 
 		 515 aa  267  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  31.4 
 
 		 510 aa  266  5e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  31.39 
 
 		 510 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  33.92 
 
 		 514 aa  266  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  31.35 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  31.63 
 
 		 507 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  31.19 
 
 		 510 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  34.14 
 
 		 508 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  32.75 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  31.79 
 
 		 512 aa  264  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  31 
 
 		 511 aa  264  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  30.92 
 
 		 511 aa  263  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  31.88 
 
 		 506 aa  262  8.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  32.68 
 
 		 528 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  33.7 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  30.63 
 
 		 510 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  32.81 
 
 		 518 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  32.14 
 
 		 511 aa  262  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  32.06 
 
 		 506 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  33.7 
 
 		 508 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  32.14 
 
 		 511 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  32.45 
 
 		 518 aa  261  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  29.74 
 
 		 506 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  31.03 
 
 		 510 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  30.48 
 
 		 538 aa  260  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  33 
 
 		 528 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  32.61 
 
 		 524 aa  260  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  30.97 
 
 		 506 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  33.26 
 
 		 514 aa  259  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  30.79 
 
 		 511 aa  259  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  29.54 
 
 		 506 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  29.54 
 
 		 506 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  29.54 
 
 		 506 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  29.96 
 
 		 511 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  32.79 
 
 		 531 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  30.1 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  30.72 
 
 		 510 aa  258  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>