More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1050 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1050  ABC transporter related  100 
 
 
231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03015  putative ATP-binding component of ABC transporter protein  72.49 
 
 
231 aa  344  5e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0182  ABC transporter related  55.65 
 
 
232 aa  270  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1054  ABC transporter related protein  37.1 
 
 
193 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  35.41 
 
 
299 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  35.41 
 
 
299 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  34.39 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  33.18 
 
 
299 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  33.93 
 
 
306 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 
299 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  33.49 
 
 
298 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  33.33 
 
 
296 aa  122  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0764  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
249 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000201929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  32.41 
 
 
339 aa  122  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.11 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  33.33 
 
 
332 aa  119  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
369 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  30.67 
 
 
316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  33.8 
 
 
341 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  33.63 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  31.78 
 
 
295 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  33.49 
 
 
305 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  34.4 
 
 
317 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  32.63 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  34.08 
 
 
310 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  32.59 
 
 
294 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  33.33 
 
 
294 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  34.21 
 
 
294 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  34.21 
 
 
303 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 
315 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 
294 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  34.11 
 
 
317 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 
244 aa  115  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 
303 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  33.02 
 
 
297 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  29.44 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  33.8 
 
 
315 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  31.8 
 
 
317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 
315 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  34.07 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
315 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  31.19 
 
 
315 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 
315 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 
315 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  31.19 
 
 
315 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.47 
 
 
309 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  31.31 
 
 
302 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  30.53 
 
 
305 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  32.91 
 
 
256 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 
315 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.82 
 
 
359 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  31.65 
 
 
325 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  30.99 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  32.56 
 
 
296 aa  112  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  31.48 
 
 
306 aa  112  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  34.53 
 
 
304 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  33.18 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  33.33 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  33.33 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2323  ABC transporter related  30.43 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  30.56 
 
 
307 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  31.88 
 
 
308 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0992  ABC transporter related protein  34.75 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  30.99 
 
 
316 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0573  ABC transporter related protein  31.37 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1375  ABC transporter related  30.41 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  31.94 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  30.49 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.25 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  32.23 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  29.54 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  30.9 
 
 
298 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  30.37 
 
 
306 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  33.8 
 
 
289 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  34.09 
 
 
306 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  30.7 
 
 
259 aa  109  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 
296 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  33.33 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2129  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  28.69 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  30.28 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.39 
 
 
363 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0074  ABC transporter related protein  32.43 
 
 
309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  34.86 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.56 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2857  ABC transporter, ATP-binding protein  31.47 
 
 
247 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00741343  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
241 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  30.91 
 
 
331 aa  108  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3071  ABC transporter related protein  30.21 
 
 
252 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2099  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  31.67 
 
 
321 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  29.86 
 
 
375 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  32.89 
 
 
250 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  31 
 
 
242 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>