More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0793 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0793  histidine kinase  100 
 
 		 673 aa  1355    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  36.96 
 
 		 680 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2085  putative signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 680 aa  330  5.0000000000000004e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0890651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4858  putative signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 584 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4845  putative signal transduction histidine kinase  23.76 
 
 		 568 aa  124  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 339 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 730 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  25.1 
 
 		 643 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  25.1 
 
 		 645 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 352 aa  89.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 344 aa  88.6  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  28.5 
 
 		 373 aa  87.4  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  31.22 
 
 		 738 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  24.08 
 
 		 645 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 582 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  21.24 
 
 		 657 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  31.9 
 
 		 797 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  32.2 
 
 		 636 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1733  histidine kinase  26.15 
 
 		 687 aa  81.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0030  putative signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 572 aa  80.9  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 658 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 348 aa  80.5  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  31.71 
 
 		 278 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  25.44 
 
 		 653 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  29.02 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  28.16 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 661 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  26.51 
 
 		 640 aa  78.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  35.35 
 
 		 670 aa  78.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0031  putative signal transduction histidine kinase  23.47 
 
 		 589 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0655535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 682 aa  78.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 650 aa  78.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 799 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  27.57 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  26.92 
 
 		 606 aa  77  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  27.86 
 
 		 456 aa  77  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 469 aa  77  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0699  histidine kinase  25.51 
 
 		 526 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00253859  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 471 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 603 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.16 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  29.82 
 
 		 287 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  42.05 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  26.21 
 
 		 799 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 553 aa  75.1  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 615 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 654 aa  74.7  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  24.25 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2102  histidine kinase  24.43 
 
 		 616 aa  74.7  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  27.87 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  26.59 
 
 		 1033 aa  74.7  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  24.73 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  27.94 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  29.27 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  29.27 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  29.44 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  23.92 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  29.06 
 
 		 632 aa  73.9  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  27.36 
 
 		 683 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  27.01 
 
 		 543 aa  73.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  26.71 
 
 		 485 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 490 aa  73.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  27.55 
 
 		 689 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  23.51 
 
 		 547 aa  73.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  27.49 
 
 		 597 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  29.05 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 695 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  22.54 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  28.91 
 
 		 470 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 312 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 461 aa  73.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 545 aa  72  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1982  sensor histidine kinase, putative  27.59 
 
 		 344 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  30 
 
 		 351 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2277  ATP-binding region, ATPase-like  41.67 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 594 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 351 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.33 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  26.72 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>