More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0030 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0030  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 572 aa  1147    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0031  putative signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 589 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0655535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4845  putative signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 568 aa  330  6e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0032  TPR repeat-containing protein  38.51 
 
 		 592 aa  324  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00127267  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4858  putative signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 584 aa  297  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  25.26 
 
 		 680 aa  90.9  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0793  histidine kinase  24.18 
 
 		 673 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  25.13 
 
 		 515 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2085  putative signal transduction histidine kinase  23.74 
 
 		 680 aa  70.5  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0890651  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 1168 aa  69.3  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  25.56 
 
 		 592 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 606 aa  65.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  23.54 
 
 		 653 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  24.47 
 
 		 575 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  24.47 
 
 		 575 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  20.92 
 
 		 643 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  25.13 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  25.13 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  24.19 
 
 		 740 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  25.13 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  25.13 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  25.13 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  25.13 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  24.47 
 
 		 575 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  26.22 
 
 		 645 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 748 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  24.75 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 775 aa  60.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 		 665 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  31.11 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  25.75 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  32.22 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  26.02 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  28.71 
 
 		 772 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 730 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.59 
 
 		 795 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  29.59 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.6 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.6 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  37.5 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  22.11 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0763  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 763 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0673199  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 		 703 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  24.28 
 
 		 1063 aa  57  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.47 
 
 		 402 aa  57  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  22.16 
 
 		 671 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.6 
 
 		 700 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  31.52 
 
 		 772 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  25 
 
 		 527 aa  56.6  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  22.52 
 
 		 401 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  29.55 
 
 		 461 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  20.33 
 
 		 475 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  20.79 
 
 		 799 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  22.82 
 
 		 680 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  27.27 
 
 		 474 aa  55.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  22.82 
 
 		 619 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  22.5 
 
 		 450 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  19.4 
 
 		 412 aa  55.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  18.97 
 
 		 411 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  27.94 
 
 		 585 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 790 aa  55.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  31.91 
 
 		 738 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  22.28 
 
 		 459 aa  55.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 501 aa  55.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2419  histidine kinase  26.92 
 
 		 380 aa  54.3  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.437374 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2894  sensor histidine kinase  25.49 
 
 		 529 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0785038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 425 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 692 aa  54.3  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 		 707 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  28.89 
 
 		 797 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 		 684 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 526 aa  54.3  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4277  histidine kinase  21.34 
 
 		 659 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.186124 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 		 384 aa  54.3  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.6 
 
 		 703 aa  54.3  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 		 682 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  27.27 
 
 		 485 aa  53.9  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0725  histidine kinase  21.45 
 
 		 1036 aa  54.3  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 485 aa  53.9  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.24 
 
 		 420 aa  53.9  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  22.69 
 
 		 468 aa  53.9  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  40.66 
 
 		 645 aa  53.5  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.56 
 
 		 480 aa  53.5  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  22.33 
 
 		 680 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  22.51 
 
 		 670 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  20.49 
 
 		 579 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  26.46 
 
 		 1809 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  19.33 
 
 		 370 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>