More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2184 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2184  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
253 aa  523  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388105 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1627  DeoR family transcriptional regulator  81.93 
 
 
250 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  3.75705e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1445  transcriptional regulator, DeoR family  81.93 
 
 
250 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1833  transcriptional regulator, DeoR family  81.93 
 
 
250 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333154  decreased coverage  0.0000836865 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1890  DeoR family transcriptional regulator  81.93 
 
 
250 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000038281 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1828  DeoR family transcriptional regulator  81.93 
 
 
250 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.582122  hitchhiker  1.2930800000000001e-23 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  79.03 
 
 
249 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2363  transcriptional regulator, DeoR family  78.63 
 
 
249 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1919  transcriptional regulator, DeoR family  79.03 
 
 
249 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00149597  hitchhiker  0.0000000000000423731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1844  DeoR family transcriptional regulator  79.03 
 
 
249 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000849222  hitchhiker  4.81659e-17 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1515  transcriptional regulator, DeoR family  78.63 
 
 
249 aa  401  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0337774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2342  DeoR family transcriptional regulator  79.03 
 
 
249 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.148271  hitchhiker  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1396  DeoR family transcriptional regulator  79.03 
 
 
249 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1487  DeoR family transcriptional regulator  79.03 
 
 
249 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000342714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2643  DeoR family transcriptional regulator  68.42 
 
 
248 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00470761  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06583  hypothetical protein  53.94 
 
 
246 aa  267  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000701  putative regulatory protein  54.66 
 
 
246 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.456965  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
251 aa  174  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0839  sugar metabolism transcriptional regulator  40 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000299847  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
257 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
260 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.33 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
261 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
254 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 
258 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 
250 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
242 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 
252 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 
260 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
256 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.05 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
258 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  29.63 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  29.46 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
256 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  29.63 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.4 
 
 
269 aa  111  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  32.54 
 
 
250 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  31.05 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  31.14 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  32.54 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  30.84 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  33.88 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  32.54 
 
 
250 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  35.16 
 
 
245 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
254 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.62 
 
 
269 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  32.06 
 
 
250 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  30.71 
 
 
262 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0642  DeoR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  29.46 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
250 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  28.4 
 
 
290 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1243  DeoR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
260 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  29.17 
 
 
289 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  28.28 
 
 
258 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
258 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  28.28 
 
 
258 aa  108  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.95 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.95 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  30.89 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.95 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.95 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.95 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.95 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5197  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.342459  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.56 
 
 
257 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
288 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
249 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 
252 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  31.17 
 
 
252 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  30.52 
 
 
252 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  29.48 
 
 
257 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  31.05 
 
 
255 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  29.36 
 
 
266 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 
254 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51900  transcriptional regualtory protein, GlmR, DeoR family  33.33 
 
 
254 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>