141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1893 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1893  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  329  8e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1928  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  73.79 
 
 
161 aa  234  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.439593  hitchhiker  0.00175211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.12 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  34.29 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.19 
 
 
140 aa  61.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.87 
 
 
148 aa  60.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.92 
 
 
135 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.1 
 
 
146 aa  57.4  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  27.21 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.03 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.45 
 
 
139 aa  55.8  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.15 
 
 
143 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  30.15 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  30.15 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  30.15 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  30.15 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  30.15 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  30.15 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  30.15 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  30.15 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.64 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  30.15 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  27.59 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  39.74 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.88 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.88 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  28.15 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.86 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3442  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.32 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11487  hitchhiker  0.00712317 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4329  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.73 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1445  iron-responsive transcriptional regulator  31.15 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0389  iron-responsive transcriptional regulator  35.9 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00187363  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3584  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.54 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  28.37 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.72 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.2 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2769  transcriptional repressor NsrR  28.95 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.07 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.06 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.46 
 
 
151 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.01 
 
 
138 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.56 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  30 
 
 
137 aa  48.5  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.75 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0421  iron-responsive transcriptional regulator  34.62 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0531604  hitchhiker  0.00267682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2975  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.57 
 
 
184 aa  48.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.672436  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2585  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.75 
 
 
171 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.867635 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4312  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.01 
 
 
191 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.784229  normal  0.0976927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1973  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.28 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  28.47 
 
 
143 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  28.47 
 
 
143 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  28.47 
 
 
143 aa  47.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  28.47 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  28.47 
 
 
143 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  28.47 
 
 
143 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  28.47 
 
 
143 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  28.47 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  28.47 
 
 
143 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  27.82 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4003  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.19 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0838  iron-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2164  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.55 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000101301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2958  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.72 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  29.27 
 
 
153 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  28.7 
 
 
156 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  28.47 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  28.47 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0538  hypothetical protein  33.01 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209147  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  28.47 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  28.47 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  28.47 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  28.47 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.44 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.41 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.64 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1753  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.61 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0830  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.04 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.6836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0098  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.67 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  29.69 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2464  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.66 
 
 
146 aa  45.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000267209  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.36 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.47 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  33.81 
 
 
148 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.5 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.57 
 
 
136 aa  44.3  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.43 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2271  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.68 
 
 
179 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448582  normal  0.516915 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20720  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  32.14 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29300  putative transcriptional regulator  24.06 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1168  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.07 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000039809  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.78 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  29.52 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3516  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.38 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00768714  normal  0.63331 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  29.52 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  29.52 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  27.78 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0579  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.17 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000125855  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.4 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.968203 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>