More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0171 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0171  LacI family transcription regulator  100 
 
 
338 aa  694    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0061  LacI family transcription regulator  74.03 
 
 
344 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5026  LacI family transcription regulator  48.07 
 
 
347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1250  LacI family transcription regulator  47.41 
 
 
356 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101547  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1651  LacI family transcription regulator  48.96 
 
 
347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1651  LacI family transcription regulator  48.66 
 
 
347 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1529  LacI family transcription regulator  47.37 
 
 
347 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.98616  normal  0.839967 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6349  LacI family transcription regulator  47.37 
 
 
347 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1729  LacI family transcription regulator  47.37 
 
 
347 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2299  LacI family transcription regulator  45.66 
 
 
347 aa  295  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2981  transcriptional regulator PtxS  46.53 
 
 
340 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1743  LacI family transcription regulator  46.42 
 
 
348 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79777  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2564  LacI family transcription regulator  45.62 
 
 
339 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35370  transcriptional regulator PtxS  46.22 
 
 
340 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118446  normal  0.0830147 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0965  LacI family transcription regulator  45.29 
 
 
347 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2285  LacI family transcription regulator  45.29 
 
 
347 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2093  LacI family transcription regulator  45.29 
 
 
347 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2150  LacI family transcription regulator  45.29 
 
 
347 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1983  LacI family transcription regulator  46.02 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2275  transcriptional regulator, LacI family  45.2 
 
 
362 aa  289  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0693  transcriptional regulator, LacI family  45.38 
 
 
354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0759  transcriptional regulator, LacI family  44.44 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.153259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  45.32 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2378  regulatory protein, LacI  45.32 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26870  transcriptional regulator PtxS  45.24 
 
 
340 aa  281  9e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677113  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2567  LacI family transcription regulator  44.41 
 
 
340 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335258  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2900  LacI family transcription regulator  41.79 
 
 
341 aa  269  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0275  LacI family transcription regulator  43.11 
 
 
361 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3703  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.91 
 
 
338 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3412  transcriptional regulator, LacI family  42.6 
 
 
342 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  39.17 
 
 
358 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1493  regulatory protein, LacI  37.91 
 
 
376 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0114  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 
341 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  31.04 
 
 
338 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  34.93 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 
340 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 
333 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0403  GalR family transcription regulator  29.94 
 
 
337 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0407  LacI family transcription regulator  29.25 
 
 
337 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.210448  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0484  LacI family transcription regulator  31.64 
 
 
335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  29.08 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.13 
 
 
336 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 
330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.23 
 
 
335 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2742  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 
331 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1186  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 
358 aa  159  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0882106  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 
347 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  32.02 
 
 
349 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3107  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.47 
 
 
352 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  32.25 
 
 
354 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  32.45 
 
 
353 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1896  sugar-binding transcriptional regulator RegR  26.41 
 
 
333 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.150149  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5418  transcriptional regulator, LacI family  30.32 
 
 
356 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263593 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5122  transcriptional regulator, LacI family  29.74 
 
 
356 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.135885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2830  transcriptional regulator, LacI family  28.78 
 
 
335 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  28.96 
 
 
331 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  30.46 
 
 
342 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1808  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.12 
 
 
327 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.379781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  28.82 
 
 
347 aa  149  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  30.25 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.81 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2860  putative transcription regulation repressor transcription regulator protein  32.84 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  28.86 
 
 
356 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  29.41 
 
 
343 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  29.41 
 
 
343 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  29.41 
 
 
343 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  29.71 
 
 
343 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  29.41 
 
 
343 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  29.71 
 
 
343 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  29.12 
 
 
343 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.03 
 
 
323 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  31.07 
 
 
342 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  29.52 
 
 
323 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  28.4 
 
 
333 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 
352 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  29.46 
 
 
340 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  29.29 
 
 
332 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4417  transcriptional regulator, LacI family  31.07 
 
 
351 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 
337 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 
332 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  29.22 
 
 
323 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  29.13 
 
 
323 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  29.13 
 
 
323 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4253  LacI family transcription regulator  32.74 
 
 
354 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  26.61 
 
 
338 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  29.66 
 
 
326 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  29.22 
 
 
323 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  29.13 
 
 
323 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4573  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 
350 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  27.86 
 
 
331 aa  142  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  29.13 
 
 
323 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  29.13 
 
 
323 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  29.08 
 
 
323 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  29.13 
 
 
323 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.83 
 
 
338 aa  142  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  29.5 
 
 
357 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.88 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>