More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1549 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 311 aa  631  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  32.97 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  30.48 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 264 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 275 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 284 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  33.09 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2371  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 263 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0360277  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 264 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 264 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 264 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  31.56 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  31.2 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 		 281 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  29.8 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5781  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  31.09 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  31.4 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  28.62 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 259 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 278 aa  99.4  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 275 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 279 aa  99  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 278 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 284 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  99  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 278 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0321  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141392  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  34.33 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  31.09 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 		 277 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 277 aa  97.1  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 278 aa  96.3  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 268 aa  95.9  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 273 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 290 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 285 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 285 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0901  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 264 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  27.31 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>