More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1271 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  100 
 
 
291 aa  584  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  61.71 
 
 
284 aa  328  7e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  55.9 
 
 
315 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  53.87 
 
 
333 aa  291  7e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  50.74 
 
 
285 aa  259  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  50.78 
 
 
299 aa  254  9e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  46.18 
 
 
285 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  46.99 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  45.99 
 
 
294 aa  232  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  46.64 
 
 
298 aa  231  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  44.83 
 
 
292 aa  226  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  42.54 
 
 
288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  47.31 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  40.24 
 
 
281 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  38.52 
 
 
278 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  33.69 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  35.53 
 
 
278 aa  145  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  42.29 
 
 
222 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  35.56 
 
 
330 aa  142  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  35.75 
 
 
278 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  40.62 
 
 
285 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  35.83 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  36.89 
 
 
318 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  44 
 
 
323 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  48.55 
 
 
272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  35.87 
 
 
305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  44.44 
 
 
317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  37.24 
 
 
368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  37.24 
 
 
368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  37.66 
 
 
368 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  40.41 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  44.51 
 
 
382 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  37.34 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  34.06 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  35.36 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  39.07 
 
 
370 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.82 
 
 
368 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  55.91 
 
 
315 aa  128  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  41.48 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.5 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  36.9 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 
352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  36.93 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.8 
 
 
345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  42.46 
 
 
383 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.17 
 
 
368 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  40 
 
 
355 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.11 
 
 
360 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  39.04 
 
 
369 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  40.8 
 
 
363 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  39.89 
 
 
356 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  51.66 
 
 
581 aa  123  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  43.1 
 
 
351 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  36.88 
 
 
285 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  34.82 
 
 
368 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  47.54 
 
 
407 aa  122  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  37.23 
 
 
287 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  37.93 
 
 
388 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  38.16 
 
 
382 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  37.21 
 
 
368 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  40.98 
 
 
362 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  37.21 
 
 
368 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  37.21 
 
 
368 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  37.21 
 
 
368 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  37.16 
 
 
360 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  39.69 
 
 
381 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  39.77 
 
 
355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  37.21 
 
 
368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  40.21 
 
 
384 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  37.21 
 
 
368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  37.21 
 
 
368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  38.95 
 
 
352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  38.95 
 
 
352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  38.82 
 
 
396 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  43.79 
 
 
344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.48 
 
 
357 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  35.27 
 
 
319 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  42.55 
 
 
370 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  40.56 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.77 
 
 
368 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  39.31 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.38 
 
 
363 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  43.66 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  36.14 
 
 
383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  33.06 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  51.97 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  34.62 
 
 
383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0234  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.41 
 
 
365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.05 
 
 
353 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  37.71 
 
 
368 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  41.49 
 
 
365 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  44.93 
 
 
357 aa  116  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  37.71 
 
 
358 aa  116  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.66 
 
 
345 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  35.74 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  39.06 
 
 
354 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  37.06 
 
 
366 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  37.14 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.25 
 
 
350 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  39.06 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>