More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3433 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 291 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  69.07 
 
 		 291 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  59.79 
 
 		 290 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  59.79 
 
 		 290 aa  353  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  59.45 
 
 		 290 aa  353  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  59.45 
 
 		 290 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  59.45 
 
 		 290 aa  349  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  58.08 
 
 		 290 aa  341  7e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  52.92 
 
 		 287 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  53.68 
 
 		 287 aa  309  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  48.11 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  52.38 
 
 		 288 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  47.08 
 
 		 291 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  43.54 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  38.35 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  38.71 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  38.35 
 
 		 294 aa  229  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  38.35 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  57.61 
 
 		 236 aa  214  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0350  GTP-binding protein Era  26.78 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  27.62 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  23.4 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  23.4 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  29.56 
 
 		 650 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0083  GTP-binding protein EngA  25.13 
 
 		 476 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  25.49 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  25.49 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  28.81 
 
 		 442 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  30.88 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  23.83 
 
 		 444 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1036  tRNA modification GTPase TrmE  28.81 
 
 		 442 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.788526  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  27.33 
 
 		 442 aa  54.3  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  32.03 
 
 		 506 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  27.32 
 
 		 438 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  26.2 
 
 		 449 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0979  tRNA modification GTPase TrmE  28.81 
 
 		 442 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.523955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  20.97 
 
 		 441 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  30.83 
 
 		 531 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  30.83 
 
 		 531 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  24.64 
 
 		 448 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.03 
 
 		 517 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  23.14 
 
 		 440 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  30.06 
 
 		 438 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  25.27 
 
 		 445 aa  53.9  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  29.31 
 
 		 438 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  24.65 
 
 		 434 aa  53.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1833  tRNA modification GTPase TrmE  30 
 
 		 444 aa  52.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  30.37 
 
 		 529 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2497  small GTP-binding protein  27.72 
 
 		 198 aa  52.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  24.86 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  25.97 
 
 		 471 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  25.64 
 
 		 462 aa  52  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  28.21 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  27.03 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  20.32 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  26.98 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  25.27 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  20 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  20 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  20 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.81 
 
 		 440 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  26.47 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  31.2 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  26.42 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  20 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  21.43 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  20 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0319  small GTP-binding protein  22.73 
 
 		 464 aa  51.2  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.236663 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  29.24 
 
 		 444 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0562  GTP-binding protein Era  25.93 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.204296  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  22.94 
 
 		 496 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  24.1 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  24 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.31 
 
 		 438 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  22.93 
 
 		 542 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  26.87 
 
 		 635 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0419  GTP-binding protein Era  24.59 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000385747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  26.73 
 
 		 629 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  20.32 
 
 		 441 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  27.15 
 
 		 440 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0320  small GTP-binding protein  22.75 
 
 		 197 aa  50.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.54 
 
 		 513 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  24.18 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  20.33 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  19.79 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1234  GTP-binding protein EngA  29.68 
 
 		 444 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  22.17 
 
 		 460 aa  50.4  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  28.17 
 
 		 523 aa  50.4  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  21.54 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  24.64 
 
 		 964 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  19.46 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.67 
 
 		 637 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  19.46 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  20.33 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  21.43 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  22.58 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  26.47 
 
 		 439 aa  49.7  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  24.76 
 
 		 438 aa  49.3  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  30.65 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  23.5 
 
 		 908 aa  49.3  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>