95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4345 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  81.01 
 
 		 389 aa  674    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  82.53 
 
 		 395 aa  678    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  78.99 
 
 		 389 aa  661    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  100 
 
 		 396 aa  813    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  77.72 
 
 		 389 aa  653    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  88.61 
 
 		 395 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  98.74 
 
 		 396 aa  806    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  75.44 
 
 		 389 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  70.13 
 
 		 389 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  69.11 
 
 		 389 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  69.04 
 
 		 391 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  67.68 
 
 		 390 aa  557  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  67.94 
 
 		 390 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  67.94 
 
 		 390 aa  557  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  68.03 
 
 		 390 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  68.03 
 
 		 390 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  65.98 
 
 		 389 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  63.45 
 
 		 391 aa  524  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  64.03 
 
 		 390 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  65.65 
 
 		 396 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  61.73 
 
 		 390 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  61.93 
 
 		 394 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  60.41 
 
 		 391 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  61.64 
 
 		 390 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  59.85 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  54.43 
 
 		 397 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  59.03 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  59.03 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  46.48 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  46.48 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  39.95 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  39.39 
 
 		 392 aa  282  9e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  39.39 
 
 		 392 aa  282  9e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  39.27 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  39.49 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  35.56 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  35.7 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  33.75 
 
 		 388 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  34.78 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  35.03 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  34.94 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  35.19 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  33.33 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  34.53 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  35.96 
 
 		 501 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  31.79 
 
 		 475 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  32.12 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  31.79 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  31.79 
 
 		 475 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  31.46 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  34.97 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  29 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  27.68 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  26.69 
 
 		 476 aa  97.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  30.58 
 
 		 428 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  24.13 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  25.53 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  33.12 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  24.15 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  27.88 
 
 		 724 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01996  hypothetical protein  25.97 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  34.67 
 
 		 501 aa  71.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  23.78 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2065  hypothetical protein  84.21 
 
 		 46 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000835722  decreased coverage  0.0000157116 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  26.26 
 
 		 585 aa  66.6  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1145  Phage tail sheath protein FI-like  23.94 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  24.77 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  24.66 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  23.79 
 
 		 514 aa  63.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  22.61 
 
 		 821 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  24.4 
 
 		 509 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  25.18 
 
 		 660 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  26.8 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  24.11 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  35.04 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  23.85 
 
 		 521 aa  59.7  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  25.3 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  23.57 
 
 		 522 aa  57  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  23.83 
 
 		 599 aa  57  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  24.43 
 
 		 521 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  24.43 
 
 		 521 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  25.08 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  27.01 
 
 		 521 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  27.27 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  22.19 
 
 		 1117 aa  53.5  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  22.1 
 
 		 514 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4914  hypothetical protein  23.15 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.832556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2247  gp21  60.53 
 
 		 49 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0752264  normal  0.0219034 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  23.59 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  28.26 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  25 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  24.29 
 
 		 551 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0923  hypothetical protein  25.28 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  22.35 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6177  major tail sheath protein FI  47.62 
 
 		 43 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>