78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2405 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  37.52 
 
 
1210 aa  701    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  37.52 
 
 
1210 aa  701    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  38.38 
 
 
1209 aa  710    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  45.81 
 
 
963 aa  790    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  86.49 
 
 
1262 aa  2201    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  37.36 
 
 
1220 aa  695    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  96.99 
 
 
1264 aa  2486    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  37.3 
 
 
1210 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  100 
 
 
1264 aa  2595    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  37.3 
 
 
1210 aa  677    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  96.91 
 
 
1264 aa  2482    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  37.38 
 
 
1210 aa  679    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  97.31 
 
 
1264 aa  2493    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  42.93 
 
 
1422 aa  837    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  37.1 
 
 
1130 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  42.83 
 
 
1216 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  43.78 
 
 
1329 aa  480  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  36.93 
 
 
1127 aa  446  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  41.01 
 
 
1297 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  39.58 
 
 
1104 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  34.66 
 
 
1116 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  38.68 
 
 
1314 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  40.31 
 
 
1083 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  39.94 
 
 
1291 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  30.63 
 
 
1125 aa  360  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  38.34 
 
 
1012 aa  355  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  37.01 
 
 
1099 aa  351  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  35.93 
 
 
1086 aa  337  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  33.46 
 
 
1086 aa  327  9e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  37.32 
 
 
1001 aa  319  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  36.6 
 
 
1055 aa  301  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  35.42 
 
 
1178 aa  274  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  36.14 
 
 
988 aa  227  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  31.82 
 
 
1137 aa  182  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  26.53 
 
 
1139 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  30.92 
 
 
1139 aa  174  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  30.92 
 
 
1139 aa  172  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  29.51 
 
 
1139 aa  168  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  27.99 
 
 
1146 aa  164  9e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  26.2 
 
 
1108 aa  147  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  27.76 
 
 
1249 aa  137  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.94 
 
 
1275 aa  136  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  29.91 
 
 
971 aa  133  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  44.22 
 
 
194 aa  121  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  23.28 
 
 
1094 aa  109  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  22.71 
 
 
465 aa  103  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  18.43 
 
 
903 aa  80.9  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  35.88 
 
 
1440 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  24.1 
 
 
898 aa  75.9  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  24.04 
 
 
789 aa  74.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  22.78 
 
 
754 aa  72.4  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  45.71 
 
 
244 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  45.71 
 
 
244 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  50.79 
 
 
1822 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  22.53 
 
 
774 aa  65.5  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  25.09 
 
 
852 aa  65.1  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  45.59 
 
 
244 aa  64.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  45.59 
 
 
244 aa  64.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  20.77 
 
 
762 aa  62.8  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  26.97 
 
 
739 aa  61.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  37.88 
 
 
1838 aa  60.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  25.3 
 
 
837 aa  59.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1411  molybdate metabolism regulator  48.21 
 
 
251 aa  58.9  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  20.86 
 
 
800 aa  58.9  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  21.43 
 
 
857 aa  58.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  25.09 
 
 
811 aa  56.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  35.29 
 
 
1822 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  23.24 
 
 
817 aa  55.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  44.07 
 
 
1030 aa  55.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  39.06 
 
 
146 aa  53.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  35.21 
 
 
1088 aa  53.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  22.43 
 
 
634 aa  53.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  22.71 
 
 
670 aa  53.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  28.89 
 
 
182 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  33.77 
 
 
263 aa  48.9  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  33.77 
 
 
263 aa  48.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3730  WGR domain-containing protein  38.03 
 
 
113 aa  47.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  26.27 
 
 
263 aa  46.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>